Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms