Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD1Q15797 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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