Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 RPL27BYDR471W 411 nt2.08□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 GCN4YEL009C 846 nt2.08□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YER079WYER079W 633 nt2.08□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YBL071CYBL071C 309 nt2.08□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 LEE1YPL054W 906 nt2.08□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YFR016CYFR016C 3702 nt2.08□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 HER1YOR227W 3741 nt2.08□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 SPO23YBR250W 1572 nt2.07□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YDR157WYDR157W 402 nt2.07□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YMR045CYMR045C 5268 nt2.06□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 RPH1YER169W 2391 nt2.06□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 RGA1YOR127W 3024 nt2.06□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 UBP1YDL122W 2430 nt2.06□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 NOP14YDL148C 2433 nt2.06□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 UBC7YMR022W 498 nt2.06□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 PGA1YNL158W 597 nt2.06□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YPR099CYPR099C 357 nt2.06□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 CAT2YML042W 2013 nt2.06□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 BRE1YDL074C 2103 nt2.06□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 ALK2YBL009W 2031 nt2.05□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 SPP41YDR464W 4308 nt2.05□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 GRR1YJR090C 3456 nt2.05□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 SWF1YDR126W 1011 nt2.05□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YDR269CYDR269C 324 nt2.05□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 BRP1YGL007W 378 nt2.05□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 SEF1YBL066C 3447 nt2.05□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.04□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 RPS24BYIL069C 408 nt2.04□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.04□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 CYB5YNL111C 363 nt2.04□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YJR098CYJR098C 1971 nt2.03□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YCR043CYCR043C 384 nt2.03□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.03□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YDL152WYDL152W 366 nt2.03□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 RPS24AYER074W 408 nt2.03□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 RTT102YGR275W 474 nt2.03□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 MRPL50YNR022C 420 nt2.03□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YBR285WYBR285W 435 nt2.03□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 PAN3YKL025C 2040 nt2.03□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 SIR4YDR227W 4077 nt2.02□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YHR138CYHR138C 345 nt2.02□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YBL108WYBL108W 306 nt2.02□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YOR053WYOR053W 342 nt2.02□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YPL238CYPL238C 390 nt2.02□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 NUP120YKL057C 3114 nt2.02□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 PLC1YPL268W 2610 nt2.02□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 GNT1YOR320C 1476 nt2.01□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YGL239CYGL239C 315 nt2.01□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 RPL42BYHR141C 321 nt2.01□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 ATP7YKL016C 525 nt2.01□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 RPL42AYNL162W 321 nt2.01□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 ZRG8YER033C 3231 nt2.01□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 PUT3YKL015W 2940 nt2.01□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 TOF2YKR010C 2316 nt2□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 TMA10YLR327C 261 nt2□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YLR434CYLR434C 384 nt2□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 DGR1YNL130C-A 147 nt2□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YOR146WYOR146W 306 nt2□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YPL182CYPL182C 384 nt2□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YPL185WYPL185W 396 nt2□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 COS111YBR203W 2775 nt2□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 MYO4YAL029C 4416 nt2□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 ARP7YPR034W 1434 nt2□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 DAS1YJL149W 1992 nt1.99□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.98□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 FKS1YLR342W 5631 nt1.98□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 TUS1YLR425W 3924 nt1.98□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 MGA2YIR033W 3342 nt1.97□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 PDR8YLR266C 2106 nt1.97□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 HCS1YKL017C 2052 nt1.97□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YDL118WYDL118W 381 nt1.97□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 BTT1YDR252W 450 nt1.97□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.97□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 RPA34YJL148W 702 nt1.97□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 CGI121YML036W 546 nt1.97□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.97□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 MMS22YLR320W 4365 nt1.97□□□□□ -2.09
NMD4Q12129 TOR2YKL203C 7425 nt1.96□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.96□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 YAR047CYAR047C 321 nt1.96□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.96□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 ELG1YOR144C 2376 nt1.95□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 TFC8YPL007C 1767 nt1.95□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 MSH6YDR097C 3729 nt1.95□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 YDL011CYDL011C 324 nt1.95□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 ATG9YDL149W 2994 nt1.95□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 WIP1YDR374W-A 270 nt1.95□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.95□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.95□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 BSC3YLR465C 309 nt1.95□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 GYP5YPL249C 2685 nt1.95□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 BUD2YKL092C 3315 nt1.94□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 EMP24YGL200C 612 nt1.94□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.94□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 RPS27AYKL156W 249 nt1.94□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 RPL9BYNL067W 576 nt1.94□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 DIS3YOL021C 3006 nt1.94□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 UBP2YOR124C 3819 nt1.93□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 HMRA1YCR097W 381 nt1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.9 ms