Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 RPL40AYIL148W 387 nt2.36□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YMR324CYMR324C 243 nt2.36□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 ASG1YIL130W 2895 nt2.36□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 TAE2YPL009C 3117 nt2.36□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 FUS1YCL027W 1539 nt2.36□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 Q0032Q0032 291 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 CSN9YDR179C 489 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 MZM1YDR493W 372 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YJL015CYJL015C 285 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YLR458WYLR458W 381 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 RPS18BYML026C 441 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YOP1YPR028W 543 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 NPR3YHL023C 3441 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 SGO1YOR073W 1773 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 ECM25YJL201W 1800 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 RLF2YPR018W 1821 nt2.35□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 PRK1YIL095W 2433 nt2.34□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YOL098CYOL098C 3114 nt2.34□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YPR097WYPR097W 3222 nt2.34□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 RPL35AYDL191W 363 nt2.34□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 ADK1YDR226W 669 nt2.34□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YER121WYER121W 345 nt2.34□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.34□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 TRM7YBR061C 933 nt2.34□□□□□ -2.03
DSE3Q08729 GYP5YPL249C 2685 nt2.34□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 IRA2YOL081W 9240 nt2.33□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 BRE1YDL074C 2103 nt2.33□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 IRC8YJL051W 2469 nt2.33□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 APC2YLR127C 2562 nt2.33□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 PSO2YMR137C 1986 nt2.33□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YPL182CYPL182C 384 nt2.33□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 MGR1YCL044C 1254 nt2.33□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 OSH6YKR003W 1347 nt2.33□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 AMS1YGL156W 3252 nt2.33□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 CYC7YEL039C 342 nt2.32□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.32□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.32□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 RAM2YKL019W 951 nt2.32□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YNL337WYNL337W 255 nt2.32□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.32□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YBT1YLL048C 4986 nt2.32□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 SWR1YDR334W 4545 nt2.31□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 snR80snR80 171 nt2.31□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 TAR1YLR154W-C 375 nt2.31□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 DGR1YNL130C-A 147 nt2.31□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 REV1YOR346W 2958 nt2.31□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.31□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 RGA1YOR127W 3024 nt2.31□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 PUF4YGL014W 2667 nt2.31□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 SIR4YDR227W 4077 nt2.3□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YGL149WYGL149W 306 nt2.3□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.3□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 PAC1YOR269W 1485 nt2.3□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 EDS1YBR033W 2760 nt2.3□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 REV3YPL167C 4515 nt2.3□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 NUP120YKL057C 3114 nt2.29□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.29□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 LCL2YLR104W 396 nt2.29□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 snR51snR51 107 nt2.29□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YJL070CYJL070C 2667 nt2.28□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 TIM9YEL020W-A 264 nt2.28□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.28□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 ALG13YGL047W 609 nt2.28□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.28□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 YGR265WYGR265W 411 nt2.28□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 RPL32YBL092W 393 nt2.28□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 TOF1YNL273W 3717 nt2.28□□□□□ -2.04
DSE3Q08729 KOG1YHR186C 4674 nt2.27□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 AIM9YER080W 1884 nt2.27□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YER189WYER189W 369 nt2.27□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.27□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YGL239CYGL239C 315 nt2.27□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 LSO2YGR169C-A 279 nt2.27□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 HSK3YKL138C-A 210 nt2.27□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 AFI1YOR129C 2682 nt2.27□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 POM152YMR129W 4014 nt2.26□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 KAR3YPR141C 2190 nt2.26□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YDL062WYDL062W 426 nt2.26□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YDR344CYDR344C 444 nt2.26□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 QCR7YDR529C 384 nt2.26□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YGR069WYGR069W 336 nt2.26□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 TIM13YGR181W 318 nt2.26□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 RGM1YMR182C 636 nt2.26□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YBR197CYBR197C 654 nt2.26□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 TRM2YKR056W 1920 nt2.26□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 RAV1YJR033C 4074 nt2.26□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 SEC31YDL195W 3822 nt2.25□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 LYS9YNR050C 1341 nt2.25□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 KSP1YHR082C 3090 nt2.25□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 SAC3YDR159W 3906 nt2.25□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 IPT1YDR072C 1584 nt2.25□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.25□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YLR255CYLR255C 354 nt2.25□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 HTB2YBL002W 396 nt2.25□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YPR099CYPR099C 357 nt2.25□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YNL018CYNL018C 1839 nt2.24□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 YDR048CYDR048C 315 nt2.24□□□□□ -2.05
DSE3Q08729 BLI1YKL061W 342 nt2.24□□□□□ -2.05
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