Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms