Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 CDC53YDL132W 2448 nt2.92□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YDR239CYDR239C 2364 nt2.92□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YDL152WYDL152W 366 nt2.92□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.92□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 SMY1YKL079W 1971 nt2.91□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YDR102CYDR102C 333 nt2.91□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.91□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 NUP100YKL068W 2880 nt2.91□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 TOF2YKR010C 2316 nt2.91□□□□□ -1.94
NSE3Q05541 YGL069CYGL069C 465 nt2.9□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.9□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 YMR320WYMR320W 306 nt2.9□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 CDC27YBL084C 2277 nt2.9□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 SNF5YBR289W 2718 nt2.9□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 TUS1YLR425W 3924 nt2.89□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 NHP2YDL208W 471 nt2.89□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 YDR413CYDR413C 576 nt2.89□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 ACM1YPL267W 630 nt2.89□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 YLR149CYLR149C 2193 nt2.88□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 PAN3YKL025C 2040 nt2.88□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 YBP1YBR216C 2025 nt2.88□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 EDS1YBR033W 2760 nt2.88□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 NOT5YPR072W 1683 nt2.88□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 SPO22YIL073C 2928 nt2.88□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 YBR184WYBR184W 1572 nt2.87□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 RBK1YCR036W 1002 nt2.87□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 YER181CYER181C 324 nt2.87□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 HCH1YNL281W 462 nt2.87□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 SCH9YHR205W 2475 nt2.86□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 DFG16YOR030W 1860 nt2.86□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 SAP190YKR028W 3102 nt2.86□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 YDR209CYDR209C 414 nt2.86□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.86□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 YER097WYER097W 330 nt2.86□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 YBR224WYBR224W 516 nt2.86□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 PEP3YLR148W 2757 nt2.86□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 ALK2YBL009W 2031 nt2.85□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 MNL2YLR057W 2550 nt2.85□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 RPL39YJL189W 156 nt2.85□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 SEF1YBL066C 3447 nt2.84□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.84□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 snR36snR36 182 nt2.84□□□□□ -1.95
NSE3Q05541 LYS9YNR050C 1341 nt2.84□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 PUT3YKL015W 2940 nt2.84□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 RKM1YPL208W 1752 nt2.84□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 SGM1YJR134C 2124 nt2.83□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 VPS13YLL040C 9435 nt2.83□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.83□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 YIL059CYIL059C 366 nt2.83□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 RPL32YBL092W 393 nt2.83□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 UBP1YDL122W 2430 nt2.83□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 MGM1YOR211C 2646 nt2.83□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 SGO1YOR073W 1773 nt2.82□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 ATG11YPR049C 3537 nt2.82□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.82□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 STB4YMR019W 2850 nt2.82□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 SIR3YLR442C 2937 nt2.81□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 YDR286CYDR286C 345 nt2.81□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 YFL032WYFL032W 321 nt2.81□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 PHS1YJL097W 654 nt2.81□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 ATP7YKL016C 525 nt2.81□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 DAD3YBR233W-A 285 nt2.81□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 MET18YIL128W 3099 nt2.81□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 SVL3YPL032C 2478 nt2.8□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 SWR1YDR334W 4545 nt2.8□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.8□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 PAU8YAL068C 363 nt2.8□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 KTI11YBL071W-A 249 nt2.8□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 PAU20YOL161C 363 nt2.8□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 YEF3YLR249W 3135 nt2.8□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 PSD2YGR170W 3417 nt2.8□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 ZRG8YER033C 3231 nt2.79□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 FLO11YIR019C 4104 nt2.79□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 SET2YJL168C 2202 nt2.79□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.79□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.79□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 RPA34YJL148W 702 nt2.79□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 YOR333CYOR333C 417 nt2.79□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 PEX8YGR077C 1770 nt2.79□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 PHO2YDL106C 1680 nt2.79□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 GUP1YGL084C 1683 nt2.79□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 SSQ1YLR369W 1974 nt2.78□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.78□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 HHT1YBR010W 411 nt2.78□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 SAP1YER047C 2694 nt2.78□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 VPH1YOR270C 2523 nt2.78□□□□□ -1.96
NSE3Q05541 STE5YDR103W 2754 nt2.78□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 PAC1YOR269W 1485 nt2.77□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 SLM1YIL105C 2061 nt2.77□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 snR65snR65 100 nt2.77□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 YRB1YDR002W 606 nt2.77□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 HYP2YEL034W 474 nt2.77□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 YBL083CYBL083C 426 nt2.77□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.77□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 MNE1YOR350C 1992 nt2.77□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 INO80YGL150C 4470 nt2.77□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 MRP10YDL045W-A 288 nt2.76□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 YFH1YDL120W 525 nt2.76□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 RPS17AYML024W 411 nt2.76□□□□□ -1.97
NSE3Q05541 FMP23YBR047W 528 nt2.76□□□□□ -1.97
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