Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 SEF1YBL066C 3447 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 MRPL32YCR003W 552 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 RTR1YER139C 681 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 LIN1YHR156C 1023 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 YLR217WYLR217W 324 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 ROM2YLR371W 4071 nt1□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 KAR1YNL188W 1302 nt1□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 YBL073WYBL073W 312 nt1□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 VAM3YOR106W 852 nt1□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 SWI4YER111C 3282 nt1□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 CDC39YCR093W 6327 nt1□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 EAF1YDR359C 2949 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 RAD50YNL250W 3939 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 STB6YKL072W 2301 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 SLX4YLR135W 2247 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 SEC3YER008C 4011 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 SMD3YLR147C 306 nt0.98□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 RPL37AYLR185W 267 nt0.98□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.98□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 YCL046WYCL046W 324 nt0.98□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 SIP4YJL089W 2490 nt0.98□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 SEC5YDR166C 2916 nt0.98□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 YJR098CYJR098C 1971 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 MAK10YEL053C 2202 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 YBR184WYBR184W 1572 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 MPC1YGL080W 393 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 RSM27YGR215W 333 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 PKR1YMR123W 369 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 DDR48YMR173W 1293 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 YNL150WYNL150W 408 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 ATP20YPR020W 348 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 BEM2YER155C 6504 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR226CQ05016 BUD3YCL014W 4911 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 VPS54YDR027C 2670 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 CHZ1YER030W 462 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 PAU18YLL064C 363 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 SPC2YML055W 537 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 PAU6YNR076W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 RRI2YOL117W 1938 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 YFR057WYFR057W 456 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 YPR170CYPR170C 336 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 KAP120YPL125W 3099 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 SGO1YOR073W 1773 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 VPS52YDR484W 1926 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 YHR054CYHR054C 1065 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 RPL42BYHR141C 321 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 RPL42AYNL162W 321 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 YPL039WYPL039W 951 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 SMC1YFL008W 3678 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 APL3YBL037W 3078 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 SEM1YDR363W-A 270 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 PAU2YEL049W 363 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 YIR020CYIR020C 303 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 MRPS8YMR158W 468 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 snR14snR14 160 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 ZRG17YNR039C 1818 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 KIP1YBL063W 3336 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 YLL054CYLL054C 2532 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 TAD1YGL243W 1203 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 RPL9BYNL067W 576 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 NUT1YGL151W 3399 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 MSS11YMR164C 2277 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 YNL114CYNL114C 372 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 SPT21YMR179W 2277 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 CLU1YMR012W 3834 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR226CQ05016 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.9□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 IRC23YOR044W 474 nt0.9□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 PIP2YOR363C 2991 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 GDS1YOR355W 1569 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 ERP4YOR016C 624 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 TTI1YKL033W 3117 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 HDA3YPR179C 1968 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 IFH1YLR223C 3258 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YCR100CYCR100C 951 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 SMB1YER029C 591 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 COX7YMR256C 183 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 HCH1YNL281W 462 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YPR147CYPR147C 915 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 SAS3YBL052C 2496 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 NUP145YGL092W 3954 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YCL020WYCL020W 1317 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 snR79snR79 84 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YER121WYER121W 345 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 TIM10YHR005C-A 282 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 LRP1YHR081W 555 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.3 ms