Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 KIP1YBL063W 3336 nt1.43□□□□□ -2.18
SYF2P53277 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 PPN1YDR452W 2025 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 BI2Q0110 1272 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 LSO2YGR169C-A 279 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 YLR269CYLR269C 351 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 EGD1YPL037C 474 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 YPR039WYPR039W 336 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 YBR174CYBR174C 315 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 YOR019WYOR019W 2193 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 CDC24YAL041W 2565 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 TDA9YML081W 3756 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF2P53277 LYS9YNR050C 1341 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF2P53277 KAR3YPR141C 2190 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF2P53277 snR79snR79 84 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF2P53277 ATP17YDR377W 306 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF2P53277 HUR1YGL168W 333 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF2P53277 YLR171WYLR171W 390 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF2P53277 snR13snR13 124 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF2P53277 SNC2YOR327C 348 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF2P53277 SEY1YOR165W 2331 nt1.4□□□□□ -2.18
SYF2P53277 FRK1YPL141C 2598 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YCR001WYCR001W 315 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YGL069CYGL069C 465 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YGR025WYGR025W 303 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF2P53277 HSK3YKL138C-A 210 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF2P53277 SYM1YLR251W 594 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF2P53277 TSC3YBR058C-A 243 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF2P53277 ARP7YPR034W 1434 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF2P53277 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 RVS161YCR009C 798 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YER121WYER121W 345 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YER135CYER135C 393 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 CDC33YOL139C 642 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 CDC27YBL084C 2277 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 IRE1YHR079C 3348 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 CCH1YGR217W 6120 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 BRR2YER172C 6492 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 RIC1YLR039C 3171 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF2P53277 NUP192YJL039C 5052 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF2P53277 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF2P53277 PFD1YJL179W 330 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF2P53277 CYB5YNL111C 363 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF2P53277 snR41snR41 95 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF2P53277 SXM1YDR395W 2835 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YJR098CYJR098C 1971 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF2P53277 SBE22YHR103W 2559 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF2P53277 NOT5YPR072W 1683 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF2P53277 TRX1YLR043C 312 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YAR068WYAR068W 486 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YBR224WYBR224W 516 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF2P53277 COX1Q0045 1605 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF2P53277 MMS22YLR320W 4365 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 NOP53YPL146C 1368 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 RPL31AYDL075W 342 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 NFU1YKL040C 771 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 CMC2YBL059C-A 330 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 SPO24YPR036W-A 204 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YPR146CYPR146C 330 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 snR54snR54 86 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 TRM3YDL112W 4311 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 SGD1YLR336C 2700 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YSW1YBR148W 1830 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF2P53277 CTF4YPR135W 2784 nt1.35□□□□□ -2.19
SYF2P53277 PLC1YPL268W 2610 nt1.35□□□□□ -2.19
SYF2P53277 NBL1YHR199C-A 222 nt1.35□□□□□ -2.19
SYF2P53277 CRG1YHR209W 876 nt1.35□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YIL102CYIL102C 306 nt1.35□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YJR157WYJR157W 363 nt1.35□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YBL083CYBL083C 426 nt1.35□□□□□ -2.19
SYF2P53277 GPX2YBR244W 489 nt1.35□□□□□ -2.19
SYF2P53277 SKI3YPR189W 4299 nt1.35□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YLR149CYLR149C 2193 nt1.34□□□□□ -2.19
SYF2P53277 SFB2YNL049C 2631 nt1.34□□□□□ -2.19
SYF2P53277 TIF11YMR260C 462 nt1.34□□□□□ -2.19
SYF2P53277 RUF22RUF22 515 nt1.34□□□□□ -2.19
SYF2P53277 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.34□□□□□ -2.19
SYF2P53277 MSS11YMR164C 2277 nt1.34□□□□□ -2.2
SYF2P53277 ZRG8YER033C 3231 nt1.34□□□□□ -2.2
SYF2P53277 SSK2YNR031C 4740 nt1.34□□□□□ -2.2
SYF2P53277 PET127YOR017W 2403 nt1.34□□□□□ -2.2
SYF2P53277 MNL2YLR057W 2550 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF2P53277 QCR7YDR529C 384 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF2P53277 ECL1YGR146C 636 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YHR125WYHR125W 306 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YJL007CYJL007C 315 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YLR101CYLR101C 396 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF2P53277 RPS18BYML026C 441 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF2P53277 YPL205CYPL205C 345 nt1.33□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32 ms