Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms