Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms