Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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