Protein–RNA interactions for Protein: Q12472

TY2B-DR1, Transposon Ty2-DR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-DR1Q12472 NNF2YGR089W 2811 nt0.21□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 TAD1YGL243W 1203 nt0.21□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 YMR099CYMR099C 894 nt0.21□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 snR13snR13 124 nt0.21□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 VMA7YGR020C 357 nt0.2□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 UPF3YGR072W 1164 nt0.2□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 FYV4YHR059W 393 nt0.2□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 PSO2YMR137C 1986 nt0.2□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 AHC2YCR082W 387 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 YLL020CYLL020C 306 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 HHT1YBR010W 411 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 RPS10AYOR293W 318 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 ALG5YPL227C 1005 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 PEX34YCL056C 435 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 YDL157CYDL157C 357 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 IRC19YLL033W 693 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 YNL226WYNL226W 411 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 FIG1YBR040W 897 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 DAS1YJL149W 1992 nt0.19□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 snR68snR68 136 nt0.18□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 FAR7YFR008W 666 nt0.18□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 YOR053WYOR053W 342 nt0.18□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 YGL109WYGL109W 324 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 REX3YLR107W 1215 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 MRPL50YNR022C 420 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 NUT1YGL151W 3399 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 BFR1YOR198C 1413 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 MGR1YCL044C 1254 nt0.17□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 TCA17YEL048C 459 nt0.16□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 SPC2YML055W 537 nt0.16□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.16□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 MSC6YOR354C 2079 nt0.15□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 UTP10YJL109C 5310 nt0.15□□□□□ -2.38
TY2B-DR1Q12472 EMC5YIL027C 426 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 RPS24BYIL069C 408 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 YIR020CYIR020C 303 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 GMC2YLR445W 567 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 CIN2YPL241C 807 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 SGO1YOR073W 1773 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 HDA3YPR179C 1968 nt0.15□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 KEG1YFR042W 603 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 GDS1YOR355W 1569 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 GIC1YHR061C 945 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 ARL3YPL051W 597 nt0.14□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 ULI1YFR026C 510 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 RPL40BYKR094C 387 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 IES4YOR189W 351 nt0.13□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 TSA2YDR453C 591 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 RTR1YER139C 681 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 snR35snR35 204 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 GLG1YKR058W 1851 nt0.12□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 SMD1YGR074W 441 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 NOP10YHR072W-A 177 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 NBP1YLR457C 960 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 SLX4YLR135W 2247 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 YFR054CYFR054C 579 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 DUO1YGL061C 744 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 RPI1YIL119C 1224 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 ABF2YMR072W 552 nt0.11□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 MXR1YER042W 555 nt0.1□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.09□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 RSM27YGR215W 333 nt0.09□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 LAG1YHL003C 1236 nt0.09□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 HAL9YOL089C 3093 nt0.09□□□□□ -2.39
TY2B-DR1Q12472 SDL1YIL167W 633 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 YMR324CYMR324C 243 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 PXA2YKL188C 2562 nt0.09□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 FUS2YMR232W 2034 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 NUP120YKL057C 3114 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 RAM2YKL019W 951 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 TIF11YMR260C 462 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 LTO1YNL260C 597 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 ENV11YGR071C 2583 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 YDL206WYDL206W 2289 nt0.08□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 YOL050CYOL050C 321 nt0.07□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 LOA1YPR139C 903 nt0.07□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 BFA1YJR053W 1725 nt0.07□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 RSM28YDR494W 1086 nt0.06□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 AFR1YDR085C 1863 nt0.06□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 VIK1YPL253C 1944 nt0.06□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 MDM36YPR083W 1740 nt0.05□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 AI3Q0060 1248 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 YGL217CYGL217C 342 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 NIP100YPL174C 2607 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 SEC5YDR166C 2916 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 BMT5YIL096C 1011 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 HSK3YKL138C-A 210 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 RPL32YBL092W 393 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 MIX23YBL107C 591 nt0.04□□□□□ -2.4
TY2B-DR1Q12472 SPO77YLR341W 1434 nt0.03□□□□□ -2.4
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