Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 SWA2YDR320C 2007 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 SIR3YLR442C 2937 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 snR70snR70 164 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 TMA22YJR014W 597 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 TMA10YLR327C 261 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 ATP15YPL271W 189 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 RLF2YPR018W 1821 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 VPS52YDR484W 1926 nt2.5□□□□□ -2.01
HER1Q12276 NUP82YJL061W 2142 nt2.5□□□□□ -2.01
HER1Q12276 SGM1YJR134C 2124 nt2.5□□□□□ -2.01
HER1Q12276 OSH6YKR003W 1347 nt2.5□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YDL011CYDL011C 324 nt2.5□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YGR265WYGR265W 411 nt2.5□□□□□ -2.01
HER1Q12276 UTP30YKR060W 825 nt2.5□□□□□ -2.01
HER1Q12276 RPL36AYMR194W 303 nt2.5□□□□□ -2.01
HER1Q12276 RKM1YPL208W 1752 nt2.5□□□□□ -2.01
HER1Q12276 RGA2YDR379W 3030 nt2.5□□□□□ -2.01
HER1Q12276 RPO41YFL036W 4056 nt2.5□□□□□ -2.01
HER1Q12276 TRA1YHR099W 11235 nt2.49□□□□□ -2.01
HER1Q12276 PSD2YGR170W 3417 nt2.49□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YDL041WYDL041W 354 nt2.49□□□□□ -2.01
HER1Q12276 WIP1YDR374W-A 270 nt2.49□□□□□ -2.01
HER1Q12276 HYP2YEL034W 474 nt2.49□□□□□ -2.01
HER1Q12276 CYC7YEL039C 342 nt2.49□□□□□ -2.01
HER1Q12276 MLH1YMR167W 2310 nt2.49□□□□□ -2.01
HER1Q12276 TCB2YNL087W 3537 nt2.49□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YPK1YKL126W 2043 nt2.49□□□□□ -2.01
HER1Q12276 SPF1YEL031W 3648 nt2.49□□□□□ -2.01
HER1Q12276 NAN1YPL126W 2691 nt2.48□□□□□ -2.01
HER1Q12276 HYR1YIR037W 492 nt2.48□□□□□ -2.01
HER1Q12276 CCW14YLR390W-A 717 nt2.48□□□□□ -2.01
HER1Q12276 RGM1YMR182C 636 nt2.48□□□□□ -2.01
HER1Q12276 snR51snR51 107 nt2.48□□□□□ -2.01
HER1Q12276 ARP8YOR141C 2646 nt2.48□□□□□ -2.01
HER1Q12276 SWR1YDR334W 4545 nt2.48□□□□□ -2.01
HER1Q12276 VPS64YDR200C 1815 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YNL018CYNL018C 1839 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 MSS11YMR164C 2277 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 ADK1YDR226W 669 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 DAD4YDR320C-A 219 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 BLI1YKL061W 342 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YML037CYML037C 1023 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 HRD3YLR207W 2502 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 BRO1YPL084W 2535 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YJL181WYJL181W 1836 nt2.47□□□□□ -2.01
HER1Q12276 HOS4YIL112W 3252 nt2.46□□□□□ -2.01
HER1Q12276 IRC10YOL015W 1761 nt2.46□□□□□ -2.02
HER1Q12276 PRK1YIL095W 2433 nt2.46□□□□□ -2.02
HER1Q12276 MZM1YDR493W 372 nt2.46□□□□□ -2.02
HER1Q12276 TAR1YLR154W-C 375 nt2.46□□□□□ -2.02
HER1Q12276 RPS18BYML026C 441 nt2.46□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YOR050CYOR050C 348 nt2.46□□□□□ -2.02
HER1Q12276 VPS13YLL040C 9435 nt2.46□□□□□ -2.02
HER1Q12276 VPS41YDR080W 2979 nt2.46□□□□□ -2.02
HER1Q12276 INP51YIL002C 2841 nt2.46□□□□□ -2.02
HER1Q12276 CDC24YAL041W 2565 nt2.45□□□□□ -2.02
HER1Q12276 snR80snR80 171 nt2.45□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YER189WYER189W 369 nt2.45□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YGL149WYGL149W 306 nt2.45□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.45□□□□□ -2.02
HER1Q12276 LCL2YLR104W 396 nt2.45□□□□□ -2.02
HER1Q12276 KTI11YBL071W-A 249 nt2.45□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YPR099CYPR099C 357 nt2.45□□□□□ -2.02
HER1Q12276 OSW7YFR039C 1533 nt2.45□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YIL166CYIL166C 1629 nt2.45□□□□□ -2.02
HER1Q12276 ECM25YJL201W 1800 nt2.45□□□□□ -2.02
HER1Q12276 LYS9YNR050C 1341 nt2.44□□□□□ -2.02
HER1Q12276 PHO2YDL106C 1680 nt2.44□□□□□ -2.02
HER1Q12276 snR79snR79 84 nt2.44□□□□□ -2.02
HER1Q12276 RPS24AYER074W 408 nt2.44□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YLR458WYLR458W 381 nt2.44□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YPL182CYPL182C 384 nt2.44□□□□□ -2.02
HER1Q12276 SSE1YPL106C 2082 nt2.44□□□□□ -2.02
HER1Q12276 SGO1YOR073W 1773 nt2.44□□□□□ -2.02
HER1Q12276 REV1YOR346W 2958 nt2.43□□□□□ -2.02
HER1Q12276 PSK2YOL045W 3306 nt2.43□□□□□ -2.02
HER1Q12276 RPL35AYDL191W 363 nt2.43□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.43□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.43□□□□□ -2.02
HER1Q12276 BAS1YKR099W 2436 nt2.43□□□□□ -2.02
HER1Q12276 CSF1YLR087C 8877 nt2.43□□□□□ -2.02
HER1Q12276 SVL3YPL032C 2478 nt2.43□□□□□ -2.02
HER1Q12276 DNA2YHR164C 4569 nt2.42□□□□□ -2.02
HER1Q12276 EDS1YBR033W 2760 nt2.42□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YLR294CYLR294C 330 nt2.42□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.42□□□□□ -2.02
HER1Q12276 MGR1YCL044C 1254 nt2.42□□□□□ -2.02
HER1Q12276 SAK1YER129W 3429 nt2.42□□□□□ -2.02
HER1Q12276 HSC82YMR186W 2118 nt2.42□□□□□ -2.02
HER1Q12276 TRS130YMR218C 3309 nt2.41□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YRB1YDR002W 606 nt2.41□□□□□ -2.02
HER1Q12276 CSN9YDR179C 489 nt2.41□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YDR344CYDR344C 444 nt2.41□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.41□□□□□ -2.02
HER1Q12276 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.41□□□□□ -2.02
HER1Q12276 HCH1YNL281W 462 nt2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.6 ms