Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 YNL211CYNL211C 261 nt3.66□□□□□ -1.82
PUS1Q12211 YOR102WYOR102W 351 nt3.66□□□□□ -1.82
PUS1Q12211 YPR014CYPR014C 330 nt3.66□□□□□ -1.82
PUS1Q12211 PUF6YDR496C 1971 nt3.65□□□□□ -1.82
PUS1Q12211 RPN1YHR027C 2982 nt3.65□□□□□ -1.82
PUS1Q12211 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.65□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.65□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.65□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.65□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 NCE101YJL205C 162 nt3.65□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 RPS21AYKR057W 264 nt3.65□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 EBS1YDR206W 2655 nt3.65□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 VAS1YGR094W 3315 nt3.64□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 TAF2YCR042C 4224 nt3.64□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YIL059CYIL059C 366 nt3.64□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.64□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YPR053CYPR053C 456 nt3.64□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 CDC24YAL041W 2565 nt3.64□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 APC2YLR127C 2562 nt3.64□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 TFB1YDR311W 1929 nt3.64□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 ARO1YDR127W 4767 nt3.63□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YIL166CYIL166C 1629 nt3.63□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 SET3YKR029C 2256 nt3.63□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YDL041WYDL041W 354 nt3.63□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YER121WYER121W 345 nt3.63□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 MDV1YJL112W 2145 nt3.62□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YOL057WYOL057W 2136 nt3.62□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 ZIP1YDR285W 2628 nt3.62□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YDR286CYDR286C 345 nt3.62□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 ERP6YGL002W 651 nt3.62□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 CSR2YPR030W 3366 nt3.62□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 ZRG17YNR039C 1818 nt3.62□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 SEC15YGL233W 2733 nt3.62□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YMR317WYMR317W 3423 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 PAN3YKL025C 2040 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 COY1YKL179C 2040 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YDR239CYDR239C 2364 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 CIN1YOR349W 3045 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 BAS1YKR099W 2436 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 SMT3YDR510W 306 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 ECM12YHR021W-A 456 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 COX23YHR116W 456 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 RPS8AYBL072C 603 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YOR345CYOR345C 351 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 ISU1YPL135W 498 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 TFC1YBR123C 1950 nt3.61□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 REG1YDR028C 3045 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 TIF4631YGR162W 2859 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 RPL38YLR325C 237 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 SIZ1YDR409W 2715 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 DOA4YDR069C 2781 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 POL2YNL262W 6669 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 FAR1YJL157C 2493 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 AUS1YOR011W 4185 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 EMC6YLL014W 327 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 YLR255CYLR255C 354 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 RPL33AYPL143W 324 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 MDN1YLR106C 14733 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 IRC3YDR332W 2070 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS1Q12211 NCL1YBL024W 2055 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 YIR044CYIR044C 186 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 RSM19YNR037C 276 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 GCN1YGL195W 8019 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 ARK1YNL020C 1917 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 GYP7YDL234C 2241 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 VPS3YDR495C 3036 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 OST4YDL232W 111 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 YBL065WYBL065W 345 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 MSS11YMR164C 2277 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 SIR3YLR442C 2937 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 YPR146CYPR146C 330 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 PEX5YDR244W 1839 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 RRM3YHR031C 2172 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 TSA2YDR453C 591 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 AIM11YER093C-A 414 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 NUP82YJL061W 2142 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 HSC82YMR186W 2118 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 SNT1YCR033W 3681 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 VTC4YJL012C 2166 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 ALY1YKR021W 2748 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 MYO5YMR109W 3660 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 YEL043WYEL043W 2871 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 MSH2YOL090W 2895 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 YML007C-AYML007C-A 111 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 COX14YML129C 213 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 SPO71YDR104C 3738 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS1Q12211 RCY1YJL204C 2523 nt3.52□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 DBP7YKR024C 2229 nt3.52□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 PDC2YDR081C 2778 nt3.52□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 NOP4YPL043W 2058 nt3.52□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 snR79snR79 84 nt3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 78.8 ms