Protein–RNA interactions for Protein: Q05931

SSQ1, Heat shock protein SSQ1, mitochondrial, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1Q05931 YNL150WYNL150W 408 nt1.34□□□□□ -2.19
SSQ1Q05931 PHO80YOL001W 882 nt1.34□□□□□ -2.19
SSQ1Q05931 PET123YOR158W 957 nt1.34□□□□□ -2.19
SSQ1Q05931 CDC31YOR257W 486 nt1.34□□□□□ -2.19
SSQ1Q05931 RTC6YPL183W-A 282 nt1.34□□□□□ -2.19
SSQ1Q05931 PHR1YOR386W 1698 nt1.34□□□□□ -2.19
SSQ1Q05931 NCA2YPR155C 1851 nt1.34□□□□□ -2.19
SSQ1Q05931 MLH3YPL164C 2148 nt1.34□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 KAP122YGL016W 3246 nt1.34□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YGR250CYGR250C 2346 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 IRE1YHR079C 3348 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 RNR4YGR180C 1038 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 SDS22YKL193C 1017 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 URA10YMR271C 684 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YNL226WYNL226W 411 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YCL002CYCL002C 792 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.33□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 MZM1YDR493W 372 nt1.32□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 PRE4YFR050C 801 nt1.32□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 MND1YGL183C 660 nt1.32□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 BET4YJL031C 984 nt1.32□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 PGA1YNL158W 597 nt1.32□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 SNC2YOR327C 348 nt1.32□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 EGD1YPL037C 474 nt1.32□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 GRX5YPL059W 453 nt1.32□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 MUD2YKL074C 1584 nt1.32□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 snR83snR83 306 nt1.31□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.31□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 TIM8YJR135W-A 264 nt1.31□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YMR324CYMR324C 243 nt1.31□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YOR152CYOR152C 771 nt1.31□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YBR063CYBR063C 1215 nt1.31□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YPR172WYPR172W 603 nt1.31□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 NUP82YJL061W 2142 nt1.31□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.3□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 RPC25YKL144C 639 nt1.3□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 RRT15YLR162W-A 189 nt1.3□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 TIF11YMR260C 462 nt1.3□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YPL080CYPL080C 327 nt1.3□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YLR422WYLR422W 5799 nt1.3□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YJR098CYJR098C 1971 nt1.3□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 ALK1YGL021W 2283 nt1.29□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 MDM32YOR147W 1869 nt1.29□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 snR5snR5 204 nt1.29□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 BNA7YDR428C 786 nt1.29□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YHL037CYHL037C 402 nt1.29□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 CIC1YHR052W 1131 nt1.29□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YHR054CYHR054C 1065 nt1.29□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 LCL2YLR104W 396 nt1.29□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt1.29□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YNL010WYNL010W 726 nt1.29□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 RPB11YOL005C 363 nt1.29□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 RRI2YOL117W 1938 nt1.28□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 YJL022WYJL022W 309 nt1.28□□□□□ -2.2
SSQ1Q05931 Q0255Q0255 1419 nt1.27□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 ANS1YHR126C 480 nt1.27□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 VPS55YJR044C 423 nt1.27□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YSY6YBR162W-A 198 nt1.27□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YLR149CYLR149C 2193 nt1.27□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 MSC6YOR354C 2079 nt1.27□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 NOT5YPR072W 1683 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YCL020WYCL020W 1317 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 CDC25YLR310C 4770 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YCR043CYCR043C 384 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YDL068WYDL068W 330 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 SPO11YHL022C 1197 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 SEC22YLR268W 645 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YNL050CYNL050C 813 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YBL083CYBL083C 426 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 GPX2YBR244W 489 nt1.26□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 MTC7YEL033W 420 nt1.25□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YGR228WYGR228W 345 nt1.25□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 GAL7YBR018C 1101 nt1.25□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 TRM732YMR259C 4263 nt1.24□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 RTR2YDR066C 591 nt1.24□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.24□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YGR283CYGR283C 1026 nt1.24□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 ATP20YPR020W 348 nt1.24□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 RLM1YPL089C 2031 nt1.23□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 MNL2YLR057W 2550 nt1.23□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 LSO2YGR169C-A 279 nt1.23□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 SEC28YIL076W 891 nt1.23□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 COF1YLL050C 432 nt1.23□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 CTK3YML112W 891 nt1.23□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YMR254CYMR254C 309 nt1.23□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YBR224WYBR224W 516 nt1.23□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 PMD1YER132C 5262 nt1.23□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 NST1YNL091W 3723 nt1.23□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 DOT6YER088C 2013 nt1.22□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 snR78snR78 87 nt1.22□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 snR9snR9 187 nt1.22□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 YJR087WYJR087W 351 nt1.22□□□□□ -2.21
SSQ1Q05931 FCF2YLR051C 654 nt1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.6 ms