Protein–RNA interactions for Protein: Q05580

HEL2, E3 ubiquitin-protein ligase HEL2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL2Q05580 ZEO1YOL109W 342 nt2.3□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 YPL080CYPL080C 327 nt2.3□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 VMA9YCL005W-A 222 nt2.3□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 UFD4YKL010C 4452 nt2.3□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 STH1YIL126W 4080 nt2.3□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 MPH1YIR002C 2982 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 SDH7YDR511W 402 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 YFR056CYFR056C 369 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 YGR025WYGR025W 303 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 RAM2YKL019W 951 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 BSC3YLR465C 309 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 RPS7BYNL096C 573 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 EGD1YPL037C 474 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 YPL197CYPL197C 414 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 YBR277CYBR277C 402 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 ATG9YDL149W 2994 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 YJL070CYJL070C 2667 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 IRC8YJL051W 2469 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 DAS1YJL149W 1992 nt2.29□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 SNX41YDR425W 1878 nt2.28□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 DPB11YJL090C 2295 nt2.28□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 RPC10YHR143W-A 213 nt2.28□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 YLR458WYLR458W 381 nt2.28□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 YPL039WYPL039W 951 nt2.28□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 MGR1YCL044C 1254 nt2.28□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 MDM32YOR147W 1869 nt2.28□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 TOR2YKL203C 7425 nt2.28□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 SAP190YKR028W 3102 nt2.28□□□□□ -2.04
HEL2Q05580 BUD2YKL092C 3315 nt2.27□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 FMP16YDR070C 282 nt2.27□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.27□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 YPR197CYPR197C 564 nt2.27□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 RTT101YJL047C 2529 nt2.27□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 PTC5YOR090C 1719 nt2.26□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.26□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 IRC4YDR540C 540 nt2.26□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 YJR011CYJR011C 786 nt2.26□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.26□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 ERP4YOR016C 624 nt2.26□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 TSC3YBR058C-A 243 nt2.26□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 KAP123YER110C 3342 nt2.26□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 UBP11YKR098C 2154 nt2.26□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 CLN3YAL040C 1743 nt2.25□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 RPS24BYIL069C 408 nt2.25□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 MRPL31YKL138C 396 nt2.25□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 CGI121YML036W 546 nt2.25□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.25□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 snR13snR13 124 nt2.25□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 BRO1YPL084W 2535 nt2.25□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 PUT3YKL015W 2940 nt2.24□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 DNF1YER166W 4716 nt2.24□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 RPA34YJL148W 702 nt2.24□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 TIM8YJR135W-A 264 nt2.24□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 SHE2YKL130C 741 nt2.24□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 TMA7YLR262C-A 195 nt2.24□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 SIP18YMR175W 240 nt2.24□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 MCD1YDL003W 1701 nt2.24□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 RTT107YHR154W 3213 nt2.24□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 RRP6YOR001W 2202 nt2.23□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 REV1YOR346W 2958 nt2.23□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 RTT102YGR275W 474 nt2.23□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 YNL146WYNL146W 303 nt2.23□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 MRPL50YNR022C 420 nt2.23□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.23□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 RAV1YJR033C 4074 nt2.23□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 NEO1YIL048W 3456 nt2.23□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 IPT1YDR072C 1584 nt2.23□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 MKT1YNL085W 2493 nt2.23□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 NUP170YBL079W 4509 nt2.22□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 RPL40AYIL148W 387 nt2.22□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.22□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 PDR8YLR266C 2106 nt2.22□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 RPS22BYLR367W 393 nt2.22□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 VTI1YMR197C 654 nt2.22□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 YOR105WYOR105W 327 nt2.22□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 YPR039WYPR039W 336 nt2.22□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 NCL1YBL024W 2055 nt2.22□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 SPC72YAL047C 1869 nt2.22□□□□□ -2.05
HEL2Q05580 RRP12YPL012W 3687 nt2.21□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 TFC3YAL001C 3483 nt2.21□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 BRP1YGL007W 378 nt2.21□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.21□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 MGA2YIR033W 3342 nt2.21□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 NAN1YPL126W 2691 nt2.2□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.2□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 NCE101YJL205C 162 nt2.2□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 MET18YIL128W 3099 nt2.2□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 NIC96YFR002W 2520 nt2.2□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 MSL1YIR009W 336 nt2.19□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.19□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 RPL37AYLR185W 267 nt2.19□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 NOP14YDL148C 2433 nt2.19□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 SEC31YDL195W 3822 nt2.18□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 EMP24YGL200C 612 nt2.18□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.18□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 COX7YMR256C 183 nt2.18□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 YOR121CYOR121C 306 nt2.18□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 REV3YPL167C 4515 nt2.17□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 CDC53YDL132W 2448 nt2.17□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 AGC1YPR021C 2709 nt2.17□□□□□ -2.06
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