Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 UTP30YKR060W 825 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS4P48567 EMC6YLL014W 327 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS4P48567 RPL26AYLR344W 384 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS4P48567 RSE1YML049C 4086 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS4P48567 NOT5YPR072W 1683 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS4P48567 ORC2YBR060C 1863 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS4P48567 SGM1YJR134C 2124 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS4P48567 LYS9YNR050C 1341 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS4P48567 SMC6YLR383W 3345 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS4P48567 HYP2YEL034W 474 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS4P48567 MBB1YJL199C 327 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YKL083WYKL083W 615 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YKR033CYKR033C 426 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YAR053WYAR053W 297 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS4P48567 ISW1YBR245C 3390 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS4P48567 MDM1YML104C 3384 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 OSW7YFR039C 1533 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 SMY1YKL079W 1971 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 DAD4YDR320C-A 219 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 WIP1YDR374W-A 270 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YGL069CYGL069C 465 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YIL174WYIL174W 228 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 HCH1YNL281W 462 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 BIL1YOR304C-A 231 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YBR224WYBR224W 516 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 CSF1YLR087C 8877 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS4P48567 NUP100YKL068W 2880 nt2.43□□□□□ -2.02
PUS4P48567 RPS24AYER074W 408 nt2.43□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YGL239CYGL239C 315 nt2.43□□□□□ -2.02
PUS4P48567 PAU8YAL068C 363 nt2.43□□□□□ -2.02
PUS4P48567 PAU20YOL161C 363 nt2.43□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YPR099CYPR099C 357 nt2.43□□□□□ -2.02
PUS4P48567 MNL2YLR057W 2550 nt2.43□□□□□ -2.02
PUS4P48567 TIM13YGR181W 318 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YKL136WYKL136W 399 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS4P48567 RPS27AYKL156W 249 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS4P48567 ISF1YMR081C 1017 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS4P48567 IRC23YOR044W 474 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS4P48567 RPS12YOR369C 432 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS4P48567 CHC1YGL206C 4962 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS4P48567 KOG1YHR186C 4674 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS4P48567 RPL40BYKR094C 387 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS4P48567 CDC27YBL084C 2277 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS4P48567 DNF1YER166W 4716 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS4P48567 NMD2YHR077C 3270 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YBR184WYBR184W 1572 nt2.4□□□□□ -2.02
PUS4P48567 ESL2YKR096W 3588 nt2.4□□□□□ -2.02
PUS4P48567 SRO77YBL106C 3033 nt2.4□□□□□ -2.02
PUS4P48567 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.4□□□□□ -2.03
PUS4P48567 CGI121YML036W 546 nt2.4□□□□□ -2.03
PUS4P48567 VPH1YOR270C 2523 nt2.4□□□□□ -2.03
PUS4P48567 PEP3YLR148W 2757 nt2.4□□□□□ -2.03
PUS4P48567 PHO2YDL106C 1680 nt2.4□□□□□ -2.03
PUS4P48567 PHO91YNR013C 2685 nt2.4□□□□□ -2.03
PUS4P48567 CLN3YAL040C 1743 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 KRE33YNL132W 3171 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 PAN3YKL025C 2040 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 TIM9YEL020W-A 264 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 RPL23BYER117W 414 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YGR107WYGR107W 450 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 PHS1YJL097W 654 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 RPS22AYJL190C 393 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 RPS17AYML024W 411 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YPL225WYPL225W 441 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 STH1YIL126W 4080 nt2.39□□□□□ -2.03
PUS4P48567 AIM9YER080W 1884 nt2.38□□□□□ -2.03
PUS4P48567 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.38□□□□□ -2.03
PUS4P48567 SCH9YHR205W 2475 nt2.38□□□□□ -2.03
PUS4P48567 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.38□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YML037CYML037C 1023 nt2.38□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YOR333CYOR333C 417 nt2.38□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.38□□□□□ -2.03
PUS4P48567 CDC53YDL132W 2448 nt2.38□□□□□ -2.03
PUS4P48567 SPO22YIL073C 2928 nt2.38□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YLR149CYLR149C 2193 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 TRS130YMR218C 3309 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YME2YMR302C 2553 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YEF3YLR249W 3135 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 RBK1YCR036W 1002 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 HSK3YKL138C-A 210 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YAF9YNL107W 681 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 RPL33AYPL143W 324 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 DAD3YBR233W-A 285 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 VMA9YCL005W-A 222 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 TOF2YKR010C 2316 nt2.37□□□□□ -2.03
PUS4P48567 SEF1YBL066C 3447 nt2.36□□□□□ -2.03
PUS4P48567 SMA2YML066C 1110 nt2.36□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YBL083CYBL083C 426 nt2.36□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YPL229WYPL229W 621 nt2.36□□□□□ -2.03
PUS4P48567 YSY6YBR162W-A 198 nt2.36□□□□□ -2.03
PUS4P48567 SET2YJL168C 2202 nt2.36□□□□□ -2.03
PUS4P48567 SIR3YLR442C 2937 nt2.35□□□□□ -2.03
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