Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHKA1P46020 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHKA1P46020 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms