Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 PGA1YNL158W 597 nt1.46□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YPR096CYPR096C 303 nt1.46□□□□□ -2.18
DDI1P40087 PIK1YNL267W 3201 nt1.46□□□□□ -2.18
DDI1P40087 MMS22YLR320W 4365 nt1.45□□□□□ -2.18
DDI1P40087 LYS9YNR050C 1341 nt1.45□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.45□□□□□ -2.18
DDI1P40087 SNO3YFL060C 669 nt1.45□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YBL083CYBL083C 426 nt1.45□□□□□ -2.18
DDI1P40087 SNO2YNL334C 669 nt1.45□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YLR149CYLR149C 2193 nt1.45□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YOR019WYOR019W 2193 nt1.45□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.45□□□□□ -2.18
DDI1P40087 TRM3YDL112W 4311 nt1.44□□□□□ -2.18
DDI1P40087 MDM20YOL076W 2391 nt1.44□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.44□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YGL015CYGL015C 393 nt1.44□□□□□ -2.18
DDI1P40087 LSO2YGR169C-A 279 nt1.44□□□□□ -2.18
DDI1P40087 SEN15YMR059W 387 nt1.44□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt1.44□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YBR224WYBR224W 516 nt1.44□□□□□ -2.18
DDI1P40087 MSH3YCR092C 3057 nt1.43□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YCR043CYCR043C 384 nt1.43□□□□□ -2.18
DDI1P40087 SCEIQ0160 708 nt1.43□□□□□ -2.18
DDI1P40087 SPO24YPR036W-A 204 nt1.43□□□□□ -2.18
DDI1P40087 SSK2YNR031C 4740 nt1.43□□□□□ -2.18
DDI1P40087 SPC110YDR356W 2835 nt1.42□□□□□ -2.18
DDI1P40087 TIM10YHR005C-A 282 nt1.42□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YJR087WYJR087W 351 nt1.42□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.42□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YOL029CYOL029C 606 nt1.42□□□□□ -2.18
DDI1P40087 NOP53YPL146C 1368 nt1.42□□□□□ -2.18
DDI1P40087 KAR3YPR141C 2190 nt1.42□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YSW1YBR148W 1830 nt1.42□□□□□ -2.18
DDI1P40087 POL5YEL055C 3069 nt1.42□□□□□ -2.18
DDI1P40087 DCP2YNL118C 2913 nt1.42□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YGR250CYGR250C 2346 nt1.41□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YJR098CYJR098C 1971 nt1.41□□□□□ -2.18
DDI1P40087 SKI3YPR189W 4299 nt1.41□□□□□ -2.18
DDI1P40087 KCS1YDR017C 3153 nt1.41□□□□□ -2.18
DDI1P40087 SGD1YLR336C 2700 nt1.41□□□□□ -2.18
DDI1P40087 IRE1YHR079C 3348 nt1.41□□□□□ -2.18
DDI1P40087 RBK1YCR036W 1002 nt1.41□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.41□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YPL197CYPL197C 414 nt1.41□□□□□ -2.18
DDI1P40087 SWT1YOR166C 1377 nt1.41□□□□□ -2.18
DDI1P40087 YLR422WYLR422W 5799 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 MSC6YOR354C 2079 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 GPM2YDL021W 936 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YDL187CYDL187C 330 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YGL024WYGL024W 336 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 SLX9YGR081C 633 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 LRP1YHR081W 555 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YIR020CYIR020C 303 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 MCM22YJR135C 720 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YLR271WYLR271W 825 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YNL319WYNL319W 441 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 NUP120YKL057C 3114 nt1.4□□□□□ -2.19
DDI1P40087 HMI1YOL095C 2121 nt1.39□□□□□ -2.19
DDI1P40087 SXM1YDR395W 2835 nt1.39□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YDR220CYDR220C 294 nt1.39□□□□□ -2.19
DDI1P40087 PRP21YJL203W 843 nt1.39□□□□□ -2.19
DDI1P40087 PET123YOR158W 957 nt1.39□□□□□ -2.19
DDI1P40087 COX1Q0045 1605 nt1.39□□□□□ -2.19
DDI1P40087 PEP3YLR148W 2757 nt1.39□□□□□ -2.19
DDI1P40087 AFR1YDR085C 1863 nt1.39□□□□□ -2.19
DDI1P40087 CTF4YPR135W 2784 nt1.38□□□□□ -2.19
DDI1P40087 UTP13YLR222C 2454 nt1.38□□□□□ -2.19
DDI1P40087 CHZ1YER030W 462 nt1.38□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt1.38□□□□□ -2.19
DDI1P40087 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt1.38□□□□□ -2.19
DDI1P40087 IRC19YLL033W 693 nt1.38□□□□□ -2.19
DDI1P40087 FYV12YOR183W 390 nt1.38□□□□□ -2.19
DDI1P40087 VPS52YDR484W 1926 nt1.38□□□□□ -2.19
DDI1P40087 LAA1YJL207C 6045 nt1.38□□□□□ -2.19
DDI1P40087 CAT8YMR280C 4302 nt1.37□□□□□ -2.19
DDI1P40087 MAD1YGL086W 2250 nt1.37□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.37□□□□□ -2.19
DDI1P40087 IES5YER092W 378 nt1.37□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.37□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YIL102CYIL102C 306 nt1.37□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YAR068WYAR068W 486 nt1.37□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YPR147CYPR147C 915 nt1.37□□□□□ -2.19
DDI1P40087 REF2YDR195W 1602 nt1.37□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YLR419WYLR419W 4308 nt1.36□□□□□ -2.19
DDI1P40087 CTR9YOL145C 3234 nt1.36□□□□□ -2.19
DDI1P40087 SMY1YKL079W 1971 nt1.36□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YDL041WYDL041W 354 nt1.36□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.36□□□□□ -2.19
DDI1P40087 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.36□□□□□ -2.19
DDI1P40087 NBP1YLR457C 960 nt1.36□□□□□ -2.19
DDI1P40087 ANS1YHR126C 480 nt1.35□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YKL111CYKL111C 336 nt1.35□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YLR252WYLR252W 306 nt1.35□□□□□ -2.19
DDI1P40087 CGI121YML036W 546 nt1.35□□□□□ -2.19
DDI1P40087 SPC98YNL126W 2541 nt1.35□□□□□ -2.19
DDI1P40087 RLM1YPL089C 2031 nt1.35□□□□□ -2.19
DDI1P40087 BST1YFL025C 3090 nt1.34□□□□□ -2.19
DDI1P40087 SNF5YBR289W 2718 nt1.34□□□□□ -2.19
DDI1P40087 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.34□□□□□ -2.19
DDI1P40087 SPO13YHR014W 876 nt1.34□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.7 ms