Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 YGR050CYGR050C 357 nt2.52□□□□□ -2.01
VFA1P40080 KTI11YBL071W-A 249 nt2.52□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt2.52□□□□□ -2.01
VFA1P40080 PDR11YIL013C 4236 nt2.52□□□□□ -2.01
VFA1P40080 WIP1YDR374W-A 270 nt2.51□□□□□ -2.01
VFA1P40080 SMD1YGR074W 441 nt2.51□□□□□ -2.01
VFA1P40080 PEX4YGR133W 552 nt2.51□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YKL136WYKL136W 399 nt2.51□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.51□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YPL182CYPL182C 384 nt2.51□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YBR277CYBR277C 402 nt2.51□□□□□ -2.01
VFA1P40080 VPS35YJL154C 2835 nt2.5□□□□□ -2.01
VFA1P40080 AMS1YGL156W 3252 nt2.5□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YDR209CYDR209C 414 nt2.5□□□□□ -2.01
VFA1P40080 NOP10YHR072W-A 177 nt2.5□□□□□ -2.01
VFA1P40080 BFA1YJR053W 1725 nt2.5□□□□□ -2.01
VFA1P40080 HOS4YIL112W 3252 nt2.5□□□□□ -2.01
VFA1P40080 CBF2YGR140W 2871 nt2.49□□□□□ -2.01
VFA1P40080 snR70snR70 164 nt2.49□□□□□ -2.01
VFA1P40080 SDC1YDR469W 528 nt2.49□□□□□ -2.01
VFA1P40080 QCR7YDR529C 384 nt2.49□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YGL024WYGL024W 336 nt2.49□□□□□ -2.01
VFA1P40080 MSL1YIR009W 336 nt2.49□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.49□□□□□ -2.01
VFA1P40080 HSC82YMR186W 2118 nt2.48□□□□□ -2.01
VFA1P40080 INO80YGL150C 4470 nt2.48□□□□□ -2.01
VFA1P40080 RPL27BYDR471W 411 nt2.48□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YAR053WYAR053W 297 nt2.48□□□□□ -2.01
VFA1P40080 DNF1YER166W 4716 nt2.48□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YOL098CYOL098C 3114 nt2.48□□□□□ -2.01
VFA1P40080 SGD1YLR336C 2700 nt2.48□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YDR186CYDR186C 2634 nt2.47□□□□□ -2.01
VFA1P40080 BUB1YGR188C 3066 nt2.47□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YGL239CYGL239C 315 nt2.47□□□□□ -2.01
VFA1P40080 ABM1YJR108W 372 nt2.47□□□□□ -2.01
VFA1P40080 RPL26AYLR344W 384 nt2.47□□□□□ -2.01
VFA1P40080 MRPL33YMR286W 261 nt2.47□□□□□ -2.01
VFA1P40080 BIL1YOR304C-A 231 nt2.47□□□□□ -2.01
VFA1P40080 PCF11YDR228C 1881 nt2.47□□□□□ -2.01
VFA1P40080 TFC3YAL001C 3483 nt2.47□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YEL043WYEL043W 2871 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 TAE2YPL009C 3117 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 VPS41YDR080W 2979 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YKL118WYKL118W 312 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 ISF1YMR081C 1017 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YAF9YNL107W 681 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YBL073WYBL073W 312 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 SNC2YOR327C 348 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YER138CYER138C 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YER160CYER160C 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YJR027WYJR027W 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YML039WYML039W 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YML045WYML045W 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YMR050CYMR050C 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 JSN1YJR091C 3276 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 SCP160YJL080C 3669 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.45□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YOR199WYOR199W 330 nt2.45□□□□□ -2.02
VFA1P40080 CLN3YAL040C 1743 nt2.45□□□□□ -2.02
VFA1P40080 GIS1YDR096W 2685 nt2.44□□□□□ -2.02
VFA1P40080 PSY1YKL076C 384 nt2.44□□□□□ -2.02
VFA1P40080 IRC23YOR044W 474 nt2.44□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YNL018CYNL018C 1839 nt2.44□□□□□ -2.02
VFA1P40080 DIS3YOL021C 3006 nt2.44□□□□□ -2.02
VFA1P40080 SOK2YMR016C 2358 nt2.43□□□□□ -2.02
VFA1P40080 IRC8YJL051W 2469 nt2.43□□□□□ -2.02
VFA1P40080 DAD4YDR320C-A 219 nt2.43□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.43□□□□□ -2.02
VFA1P40080 KAP123YER110C 3342 nt2.43□□□□□ -2.02
VFA1P40080 MMS22YLR320W 4365 nt2.42□□□□□ -2.02
VFA1P40080 RPS24AYER074W 408 nt2.42□□□□□ -2.02
VFA1P40080 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.42□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.42□□□□□ -2.02
VFA1P40080 PGA1YNL158W 597 nt2.42□□□□□ -2.02
VFA1P40080 TIM18YOR297C 579 nt2.42□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YPR099CYPR099C 357 nt2.42□□□□□ -2.02
VFA1P40080 SAP190YKR028W 3102 nt2.42□□□□□ -2.02
VFA1P40080 RRP6YOR001W 2202 nt2.42□□□□□ -2.02
VFA1P40080 AIM9YER080W 1884 nt2.41□□□□□ -2.02
VFA1P40080 SAP185YJL098W 3177 nt2.41□□□□□ -2.02
VFA1P40080 AFI1YOR129C 2682 nt2.41□□□□□ -2.02
VFA1P40080 UFD4YKL010C 4452 nt2.41□□□□□ -2.02
VFA1P40080 CDC50YCR094W 1176 nt2.41□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YDR102CYDR102C 333 nt2.41□□□□□ -2.02
VFA1P40080 TWF1YGR080W 999 nt2.41□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YPR203WYPR203W 309 nt2.41□□□□□ -2.02
VFA1P40080 YFR016CYFR016C 3702 nt2.41□□□□□ -2.02
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