Protein–RNA interactions for Protein: P38351

PAF1, RNA polymerase II-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAF1P38351 snR79snR79 84 nt2.82□□□□□ -1.96
PAF1P38351 ZEO1YOL109W 342 nt2.82□□□□□ -1.96
PAF1P38351 IPT1YDR072C 1584 nt2.82□□□□□ -1.96
PAF1P38351 ORC2YBR060C 1863 nt2.82□□□□□ -1.96
PAF1P38351 GRX8YLR364W 330 nt2.81□□□□□ -1.96
PAF1P38351 YML084WYML084W 309 nt2.81□□□□□ -1.96
PAF1P38351 YMR324CYMR324C 243 nt2.81□□□□□ -1.96
PAF1P38351 LEE1YPL054W 906 nt2.81□□□□□ -1.96
PAF1P38351 DAD3YBR233W-A 285 nt2.81□□□□□ -1.96
PAF1P38351 BFA1YJR053W 1725 nt2.8□□□□□ -1.96
PAF1P38351 COX1Q0045 1605 nt2.8□□□□□ -1.96
PAF1P38351 CDC50YCR094W 1176 nt2.8□□□□□ -1.96
PAF1P38351 BTT1YDR252W 450 nt2.8□□□□□ -1.96
PAF1P38351 EGD1YPL037C 474 nt2.8□□□□□ -1.96
PAF1P38351 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.8□□□□□ -1.96
PAF1P38351 ISW1YBR245C 3390 nt2.8□□□□□ -1.96
PAF1P38351 NAN1YPL126W 2691 nt2.8□□□□□ -1.96
PAF1P38351 FAB1YFR019W 6837 nt2.79□□□□□ -1.96
PAF1P38351 TOR2YKL203C 7425 nt2.79□□□□□ -1.96
PAF1P38351 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.79□□□□□ -1.96
PAF1P38351 YOL159CYOL159C 516 nt2.79□□□□□ -1.96
PAF1P38351 YOR392WYOR392W 444 nt2.79□□□□□ -1.96
PAF1P38351 SAK1YER129W 3429 nt2.78□□□□□ -1.96
PAF1P38351 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.78□□□□□ -1.96
PAF1P38351 LSO2YGR169C-A 279 nt2.78□□□□□ -1.96
PAF1P38351 RRF1YHR038W 693 nt2.78□□□□□ -1.96
PAF1P38351 NUP100YKL068W 2880 nt2.78□□□□□ -1.97
PAF1P38351 KAR3YPR141C 2190 nt2.77□□□□□ -1.97
PAF1P38351 IRC8YJL051W 2469 nt2.77□□□□□ -1.97
PAF1P38351 KRE33YNL132W 3171 nt2.77□□□□□ -1.97
PAF1P38351 YDR269CYDR269C 324 nt2.77□□□□□ -1.97
PAF1P38351 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.77□□□□□ -1.97
PAF1P38351 NOP10YHR072W-A 177 nt2.77□□□□□ -1.97
PAF1P38351 SNC1YAL030W 354 nt2.77□□□□□ -1.97
PAF1P38351 SEC22YLR268W 645 nt2.77□□□□□ -1.97
PAF1P38351 ERP4YOR016C 624 nt2.77□□□□□ -1.97
PAF1P38351 RTC6YPL183W-A 282 nt2.77□□□□□ -1.97
PAF1P38351 SPC72YAL047C 1869 nt2.77□□□□□ -1.97
PAF1P38351 YER079WYER079W 633 nt2.76□□□□□ -1.97
PAF1P38351 DGR1YNL130C-A 147 nt2.76□□□□□ -1.97
PAF1P38351 TRS130YMR218C 3309 nt2.76□□□□□ -1.97
PAF1P38351 AFI1YOR129C 2682 nt2.75□□□□□ -1.97
PAF1P38351 SIR3YLR442C 2937 nt2.75□□□□□ -1.97
PAF1P38351 snR56snR56 88 nt2.75□□□□□ -1.97
PAF1P38351 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.75□□□□□ -1.97
PAF1P38351 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.75□□□□□ -1.97
PAF1P38351 NFU1YKL040C 771 nt2.75□□□□□ -1.97
PAF1P38351 SWF1YDR126W 1011 nt2.74□□□□□ -1.97
PAF1P38351 SMD1YGR074W 441 nt2.74□□□□□ -1.97
PAF1P38351 RPS18BYML026C 441 nt2.74□□□□□ -1.97
PAF1P38351 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.74□□□□□ -1.97
PAF1P38351 VMA9YCL005W-A 222 nt2.74□□□□□ -1.97
PAF1P38351 UBR1YGR184C 5853 nt2.74□□□□□ -1.97
PAF1P38351 FKS1YLR342W 5631 nt2.74□□□□□ -1.97
PAF1P38351 PAU8YAL068C 363 nt2.73□□□□□ -1.97
PAF1P38351 YLR287CYLR287C 1068 nt2.73□□□□□ -1.97
PAF1P38351 PAU20YOL161C 363 nt2.73□□□□□ -1.97
PAF1P38351 SNC2YOR327C 348 nt2.73□□□□□ -1.97
PAF1P38351 YPR012WYPR012W 255 nt2.73□□□□□ -1.97
PAF1P38351 YPR146CYPR146C 330 nt2.73□□□□□ -1.97
PAF1P38351 YBR285WYBR285W 435 nt2.73□□□□□ -1.97
PAF1P38351 RAV1YJR033C 4074 nt2.73□□□□□ -1.97
PAF1P38351 PHO2YDL106C 1680 nt2.73□□□□□ -1.97
PAF1P38351 RPL27BYDR471W 411 nt2.72□□□□□ -1.97
PAF1P38351 SDH7YDR511W 402 nt2.72□□□□□ -1.97
PAF1P38351 URM1YIL008W 300 nt2.72□□□□□ -1.97
PAF1P38351 MSL1YIR009W 336 nt2.72□□□□□ -1.97
PAF1P38351 KIP1YBL063W 3336 nt2.71□□□□□ -1.97
PAF1P38351 MKT1YNL085W 2493 nt2.71□□□□□ -1.97
PAF1P38351 SGD1YLR336C 2700 nt2.71□□□□□ -1.98
PAF1P38351 DIE2YGR227W 1578 nt2.71□□□□□ -1.98
PAF1P38351 YLR334CYLR334C 381 nt2.71□□□□□ -1.98
PAF1P38351 YOR053WYOR053W 342 nt2.71□□□□□ -1.98
PAF1P38351 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.71□□□□□ -1.98
PAF1P38351 GIP3YPL137C 3831 nt2.71□□□□□ -1.98
PAF1P38351 YER121WYER121W 345 nt2.7□□□□□ -1.98
PAF1P38351 YHR138CYHR138C 345 nt2.7□□□□□ -1.98
PAF1P38351 VTI1YMR197C 654 nt2.7□□□□□ -1.98
PAF1P38351 CDC24YAL041W 2565 nt2.7□□□□□ -1.98
PAF1P38351 CRM1YGR218W 3255 nt2.69□□□□□ -1.98
PAF1P38351 CBS1YDL069C 690 nt2.69□□□□□ -1.98
PAF1P38351 TIM9YEL020W-A 264 nt2.69□□□□□ -1.98
PAF1P38351 FCF2YLR051C 654 nt2.69□□□□□ -1.98
PAF1P38351 RPS17AYML024W 411 nt2.69□□□□□ -1.98
PAF1P38351 VPS35YJL154C 2835 nt2.69□□□□□ -1.98
PAF1P38351 SWT1YOR166C 1377 nt2.68□□□□□ -1.98
PAF1P38351 RIC1YLR039C 3171 nt2.68□□□□□ -1.98
PAF1P38351 TOF1YNL273W 3717 nt2.68□□□□□ -1.98
PAF1P38351 PEP1YBL017C 4740 nt2.67□□□□□ -1.98
PAF1P38351 CDC53YDL132W 2448 nt2.67□□□□□ -1.98
PAF1P38351 YRB1YDR002W 606 nt2.67□□□□□ -1.98
PAF1P38351 YGL024WYGL024W 336 nt2.67□□□□□ -1.98
PAF1P38351 TMA22YJR014W 597 nt2.67□□□□□ -1.98
PAF1P38351 YBL012CYBL012C 402 nt2.67□□□□□ -1.98
PAF1P38351 MCD1YDL003W 1701 nt2.66□□□□□ -1.98
PAF1P38351 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.66□□□□□ -1.98
PAF1P38351 RPS24BYIL069C 408 nt2.66□□□□□ -1.98
PAF1P38351 YPL185WYPL185W 396 nt2.66□□□□□ -1.98
PAF1P38351 DAS1YJL149W 1992 nt2.66□□□□□ -1.98
PAF1P38351 SIR4YDR227W 4077 nt2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.7 ms