Protein–RNA interactions for Protein: P0CX28

RPL42B, 60S ribosomal protein L42-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL42BP0CX28 RBK1YCR036W 1002 nt2.18□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 YDR344CYDR344C 444 nt2.18□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.18□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 YPR099CYPR099C 357 nt2.18□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 MET6YER091C 2304 nt2.17□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 HRD3YLR207W 2502 nt2.17□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 FMP16YDR070C 282 nt2.17□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 CYC7YEL039C 342 nt2.17□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 YIL059CYIL059C 366 nt2.17□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 RPL33AYPL143W 324 nt2.17□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 SOK2YMR016C 2358 nt2.17□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 SDC25YLL016W 3147 nt2.17□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 SSN2YDR443C 4263 nt2.17□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 VPS35YJL154C 2835 nt2.16□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 YGR067CYGR067C 2415 nt2.16□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 JLP2YMR132C 627 nt2.16□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 SNC2YOR327C 348 nt2.16□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 YPR203WYPR203W 309 nt2.16□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 RGA2YDR379W 3030 nt2.16□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 SNU114YKL173W 3027 nt2.16□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 DFG16YOR030W 1860 nt2.16□□□□□ -2.06
RPL42BP0CX28 YDR048CYDR048C 315 nt2.15□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YDR209CYDR209C 414 nt2.15□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YIL174WYIL174W 228 nt2.15□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.15□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 RPL36AYMR194W 303 nt2.15□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YNL337WYNL337W 255 nt2.15□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.15□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 VMA9YCL005W-A 222 nt2.15□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 SRB8YCR081W 4284 nt2.15□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 ILS1YBL076C 3219 nt2.15□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 TOF2YKR010C 2316 nt2.14□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 SIN3YOL004W 4611 nt2.14□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 RRP12YPL012W 3687 nt2.14□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 FMP32YFL046W 624 nt2.14□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.14□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 PHS1YJL097W 654 nt2.14□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.14□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 MRPL33YMR286W 261 nt2.14□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.14□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 JSN1YJR091C 3276 nt2.14□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 PFF1YBR074W 2931 nt2.14□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 PAN3YKL025C 2040 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YDR186CYDR186C 2634 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 VPS16YPL045W 2397 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 RIM20YOR275C 1986 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YDL211CYDL211C 1119 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YGL069CYGL069C 465 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YGR069WYGR069W 336 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 SMA2YML066C 1110 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 BFA1YJR053W 1725 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 KAP123YER110C 3342 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 ALK2YBL009W 2031 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 BCK1YJL095W 4437 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 TRA1YHR099W 11235 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 PRP8YHR165C 7242 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 SMD1YGR074W 441 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YIL102CYIL102C 306 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YLR053CYLR053C 327 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YML037CYML037C 1023 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 LCL1YPL056C 306 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 SAR1YPL218W 573 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 PAU10YDR542W 363 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 PAU11YGL261C 363 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YHL041WYHL041W 450 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 NOP10YHR072W-A 177 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 PAU4YLR461W 363 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 MMS22YLR320W 4365 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 NUM1YDR150W 8247 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 DBP6YNR038W 1890 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 LYS9YNR050C 1341 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YOR296WYOR296W 3870 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 TAE2YPL009C 3117 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 INP53YOR109W 3324 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.1□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 ACB1YGR037C 264 nt2.1□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 BLI1YKL061W 342 nt2.1□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 SUL1YBR294W 2580 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 TMN3YER113C 2121 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 GUP1YGL084C 1683 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 RIC1YLR039C 3171 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 RTT10YPL183C 3042 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 ALG13YGL047W 609 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 RPS22AYJL190C 393 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 RPL38YLR325C 237 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL42BP0CX28 BNR1YIL159W 4128 nt2.09□□□□□ -2.08
RPL42BP0CX28 SMY1YKL079W 1971 nt2.09□□□□□ -2.08
RPL42BP0CX28 NFT1YKR103W 3657 nt2.09□□□□□ -2.08
RPL42BP0CX28 PRE4YFR050C 801 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL42BP0CX28 YHL042WYHL042W 453 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL42BP0CX28 YIL032CYIL032C 357 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL42BP0CX28 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL42BP0CX28 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL42BP0CX28 HHT1YBR010W 411 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL42BP0CX28 YBR277CYBR277C 402 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL42BP0CX28 ESL2YKR096W 3588 nt2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.1 ms