Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFLP07196 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFLP07196 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFLP07196 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEFLP07196 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms