Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNE2O96020 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE2O96020 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms