Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPK3BL2E5RIL1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BL2E5RIL1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms