Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BHLHA9Q7RTU4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms