Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3C1V9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3C1V9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3C1V9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3C1V9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3C1V9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3C1V9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3C1V9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3C1V9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3C1V9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3C1V9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3C1V9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3C1V9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms