Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YNL034WYNL034W 1839 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 TRM2YKR056W 1920 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 YEL057CYEL057C 702 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 AAD16YFL057C 459 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 PEX4YGR133W 552 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 MSL1YIR009W 336 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 TIM8YJR135W-A 264 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 snR36snR36 182 nt2.56□□□□□ -2
PUF2Q12221 YDR209CYDR209C 414 nt2.55□□□□□ -2
PUF2Q12221 RPS17BYDR447C 411 nt2.55□□□□□ -2 RIP-Chip
PUF2Q12221 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.55□□□□□ -2
PUF2Q12221 RPS22BYLR367W 393 nt2.55□□□□□ -2 RIP-Chip
PUF2Q12221 UTP14YML093W 2700 nt2.55□□□□□ -2
PUF2Q12221 VPS41YDR080W 2979 nt2.54□□□□□ -2
PUF2Q12221 CAJ1YER048C 1176 nt2.54□□□□□ -2
PUF2Q12221 YFR056CYFR056C 369 nt2.54□□□□□ -2
PUF2Q12221 PAU14YIL176C 363 nt2.54□□□□□ -2
PUF2Q12221 PAU1YJL223C 363 nt2.54□□□□□ -2
PUF2Q12221 ESF2YNR054C 951 nt2.54□□□□□ -2
PUF2Q12221 EGD1YPL037C 474 nt2.54□□□□□ -2 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPB1YCL054W 2526 nt2.54□□□□□ -2
PUF2Q12221 PFF1YBR074W 2931 nt2.54□□□□□ -2
PUF2Q12221 RLF2YPR018W 1821 nt2.54□□□□□ -2
PUF2Q12221 NPR3YHL023C 3441 nt2.54□□□□□ -2
PUF2Q12221 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.53□□□□□ -2
PUF2Q12221 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.53□□□□□ -2
PUF2Q12221 YMR320WYMR320W 306 nt2.53□□□□□ -2
PUF2Q12221 YOR055WYOR055W 435 nt2.53□□□□□ -2
PUF2Q12221 SSN2YDR443C 4263 nt2.53□□□□□ -2 RIP-Chip
PUF2Q12221 YIL166CYIL166C 1629 nt2.53□□□□□ -2
PUF2Q12221 GCV2YMR189W 3105 nt2.52□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 FIR1YER032W 2631 nt2.52□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 ADK1YDR226W 669 nt2.52□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 YLR031WYLR031W 561 nt2.52□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 RPL9BYNL067W 576 nt2.52□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 COX1Q0045 1605 nt2.52□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 SRO77YBL106C 3033 nt2.52□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 SSY1YDR160W 2559 nt2.51□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 YIL058WYIL058W 285 nt2.51□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 YBL073WYBL073W 312 nt2.51□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 PGA1YNL158W 597 nt2.51□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 PUF4YGL014W 2667 nt2.51□□□□□ -2.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBP1YBR216C 2025 nt2.51□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 SRB8YCR081W 4284 nt2.51□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 ECM5YMR176W 4236 nt2.5□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 SLH1YGR271W 5904 nt2.5□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 TMA10YLR327C 261 nt2.5□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 IRC23YOR044W 474 nt2.5□□□□□ -2.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 NAB6YML117W 3405 nt2.49□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 TPS2YDR074W 2691 nt2.49□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 PHO91YNR013C 2685 nt2.49□□□□□ -2.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 CYR1YJL005W 6081 nt2.49□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.49□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 NCE101YJL205C 162 nt2.49□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 COX7YMR256C 183 nt2.49□□□□□ -2.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 MSB1YOR188W 3414 nt2.49□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 GEA1YJR031C 4227 nt2.49□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 ARP8YOR141C 2646 nt2.48□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 YJL016WYJL016W 1686 nt2.48□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 SPG3YDR504C 384 nt2.48□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 TMA22YJR014W 597 nt2.48□□□□□ -2.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 PSY1YKL076C 384 nt2.48□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 YBT1YLL048C 4986 nt2.47□□□□□ -2.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 VPS52YDR484W 1926 nt2.47□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 GCN4YEL009C 846 nt2.47□□□□□ -2.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 YFL063WYFL063W 456 nt2.47□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 HYR1YIR037W 492 nt2.47□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 FCF2YLR051C 654 nt2.47□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 MRPL33YMR286W 261 nt2.47□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 LCL1YPL056C 306 nt2.47□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 TRM7YBR061C 933 nt2.47□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 YPL229WYPL229W 621 nt2.47□□□□□ -2.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATP15YPL271W 189 nt2.47□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 YPK1YKL126W 2043 nt2.47□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 NUP82YJL061W 2142 nt2.47□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 LEU3YLR451W 2661 nt2.46□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 VTC3YPL019C 2508 nt2.46□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 SSE1YPL106C 2082 nt2.46□□□□□ -2.01
PUF2Q12221 STE11YLR362W 2154 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YDL041WYDL041W 354 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 TMN3YER113C 2121 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 UTP30YKR060W 825 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 RGM1YMR182C 636 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 PSO2YMR137C 1986 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YDR239CYDR239C 2364 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 OSW7YFR039C 1533 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 ESC1YMR219W 4977 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YER138CYER138C 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YER160CYER160C 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YJR027WYJR027W 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
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