Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 RCN1YKL159C 636 nt1.91□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YPR096CYPR096C 303 nt1.91□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 HSH155YMR288W 2916 nt1.9□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 SEC63YOR254C 1992 nt1.9□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YDL187CYDL187C 330 nt1.9□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 VTC1YER072W 390 nt1.9□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YFL012WYFL012W 447 nt1.9□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 SPC1YJR010C-A 285 nt1.9□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 RPS22BYLR367W 393 nt1.9□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 PGA1YNL158W 597 nt1.9□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YPR172WYPR172W 603 nt1.9□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 FAB1YFR019W 6837 nt1.9□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt1.89□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 GPX2YBR244W 489 nt1.89□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 FKS1YLR342W 5631 nt1.89□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.89□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 SET2YJL168C 2202 nt1.89□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YNL144CYNL144C 2223 nt1.89□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 NUP82YJL061W 2142 nt1.88□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YGR018CYGR018C 330 nt1.88□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 TIM8YJR135W-A 264 nt1.88□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YLR252WYLR252W 306 nt1.88□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 RPS7BYNL096C 573 nt1.88□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 MSH6YDR097C 3729 nt1.88□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 KOG1YHR186C 4674 nt1.88□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 ARP7YPR034W 1434 nt1.88□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 SEY1YOR165W 2331 nt1.88□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YJR039WYJR039W 3366 nt1.87□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 PKH3YDR466W 2697 nt1.87□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 PAU3YCR104W 375 nt1.87□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 BTT1YDR252W 450 nt1.87□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 SPO13YHR014W 876 nt1.87□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.87□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 AFB1YLR040C 675 nt1.87□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 MYO2YOR326W 4725 nt1.87□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 ATP15YPL271W 189 nt1.87□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 MSS18YPR134W 807 nt1.87□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 REF2YDR195W 1602 nt1.87□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 UTP13YLR222C 2454 nt1.86□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 ZRG8YER033C 3231 nt1.86□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 MUD2YKL074C 1584 nt1.86□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 IES5YER092W 378 nt1.86□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YGL069CYGL069C 465 nt1.86□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 GIC1YHR061C 945 nt1.86□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YIR020CYIR020C 303 nt1.86□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 SYM1YLR251W 594 nt1.86□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YBL012CYBL012C 402 nt1.86□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YPL197CYPL197C 414 nt1.86□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 PLC1YPL268W 2610 nt1.86□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 MNL2YLR057W 2550 nt1.85□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.85□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt1.85□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 SPC29YPL124W 762 nt1.85□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 RTC6YPL183W-A 282 nt1.85□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 MYO4YAL029C 4416 nt1.85□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YJL016WYJL016W 1686 nt1.85□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 TFC8YPL007C 1767 nt1.85□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 YDR042CYDR042C 603 nt1.84□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 RTR2YDR066C 591 nt1.84□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 HSK3YKL138C-A 210 nt1.84□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 SIP18YMR175W 240 nt1.84□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 MRPL44YMR225C 297 nt1.84□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 SAR1YPL218W 573 nt1.84□□□□□ -2.11
NFI1Q12216 SGD1YLR336C 2700 nt1.83□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.83□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 ATP7YKL016C 525 nt1.83□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YPR147CYPR147C 915 nt1.83□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YLR149CYLR149C 2193 nt1.83□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 NOP53YPL146C 1368 nt1.83□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 HNT1YDL125C 477 nt1.82□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.82□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YIL029CYIL029C 429 nt1.82□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 SEC22YLR268W 645 nt1.82□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YLR271WYLR271W 825 nt1.82□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 TBS1YBR150C 3285 nt1.81□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 RTP1YMR185W 2946 nt1.81□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 NCE101YJL205C 162 nt1.81□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.81□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 DAS1YJL149W 1992 nt1.81□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 SLM1YIL105C 2061 nt1.81□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 VMR1YHL035C 4779 nt1.81□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YDR220CYDR220C 294 nt1.8□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.8□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.8□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 AIM18YHR198C 966 nt1.8□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.8□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YKL111CYKL111C 336 nt1.8□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 SEN15YMR059W 387 nt1.8□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YOR152CYOR152C 771 nt1.8□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YBR174CYBR174C 315 nt1.8□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 NOT5YPR072W 1683 nt1.8□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 RKM1YPL208W 1752 nt1.8□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 SMY1YKL079W 1971 nt1.79□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YPP1YGR198W 2454 nt1.79□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 CHC1YGL206C 4962 nt1.79□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 OCA6YDR067C 675 nt1.79□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 GMC2YLR445W 567 nt1.79□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 HSL1YKL101W 4557 nt1.78□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YCR043CYCR043C 384 nt1.78□□□□□ -2.12
NFI1Q12216 YMR324CYMR324C 243 nt1.78□□□□□ -2.12
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