Protein–RNA interactions for Protein: Q07532

IWR1, RNA polymerase II nuclear localization protein IWR1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 353 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IWR1	Q07532	PTC5	YOR090C	1719 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	AMS1	YGL156W	3252 nt		2.62	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YDL025W-A	YDL025W-A	105 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	MZM1	YDR493W	372 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	ACB1	YGR037C	264 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YGR050C	YGR050C	357 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YIL156W-B	YIL156W-B	222 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YNL010W	YNL010W	726 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	LSM7	YNL147W	348 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YPR203W	YPR203W	309 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	VPS16	YPL045W	2397 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	IRC10	YOL015W	1761 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	RLI1	YDR091C	1827 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	VPS41	YDR080W	2979 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	REV1	YOR346W	2958 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	NCL1	YBL024W	2055 nt		2.61	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	COX1	Q0045	1605 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	HOS4	YIL112W	3252 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YFR056C	YFR056C	369 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	RPS24B	YIL069C	408 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	UBC7	YMR022W	498 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	MRPL33	YMR286W	261 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YOR029W	YOR029W	336 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	EGD1	YPL037C	474 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YPL185W	YPL185W	396 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	INP51	YIL002C	2841 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	DIE2	YGR227W	1578 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YIL080W	YIL080W	4722 nt		2.6	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	MSS11	YMR164C	2277 nt		2.59	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	SRB8	YCR081W	4284 nt		2.59	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	SAK1	YER129W	3429 nt		2.59	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	KEL2	YGR238C	2649 nt		2.59	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	MPH1	YIR002C	2982 nt		2.59	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	IPT1	YDR072C	1584 nt		2.59	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	CBS1	YDL069C	690 nt		2.59	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YLR287C	YLR287C	1068 nt		2.59	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	BSC3	YLR465C	309 nt		2.59	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	MRPL50	YNR022C	420 nt		2.59	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	PDR11	YIL013C	4236 nt		2.59	□□□□□ -1.99
IWR1	Q07532	YJL070C	YJL070C	2667 nt		2.59	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	PHO91	YNR013C	2685 nt		2.58	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	ESC1	YMR219W	4977 nt		2.58	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	PRK1	YIL095W	2433 nt		2.58	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	snR79	snR79	84 nt		2.58	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		2.58	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	INP53	YOR109W	3324 nt		2.58	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	MRD1	YPR112C	2664 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	ATG31	YDR022C	591 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	FMP16	YDR070C	282 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	YDR209C	YDR209C	414 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	URM1	YIL008W	300 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	SHE2	YKL130C	741 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	YLR434C	YLR434C	384 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	YMR324C	YMR324C	243 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	YBR012C	YBR012C	420 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	YBR277C	YBR277C	402 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	NAN1	YPL126W	2691 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	HSC82	YMR186W	2118 nt		2.57	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	JSN1	YJR091C	3276 nt		2.56	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	SEC22	YLR268W	645 nt		2.56	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	GRX8	YLR364W	330 nt		2.56	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	STE11	YLR362W	2154 nt		2.56	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	MSB1	YOR188W	3414 nt		2.55	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	SDC1	YDR469W	528 nt		2.55	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	TMN3	YER113C	2121 nt		2.55	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	PAU14	YIL176C	363 nt		2.55	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	PAU1	YJL223C	363 nt		2.55	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	RPS18B	YML026C	441 nt		2.55	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	YNL018C	YNL018C	1839 nt		2.55	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	SWT1	YOR166C	1377 nt		2.55	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	VTC3	YPL019C	2508 nt		2.55	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	CDC24	YAL041W	2565 nt		2.54	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	PSY1	YKL076C	384 nt		2.54	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	YOR146W	YOR146W	306 nt		2.54	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	CBF2	YGR140W	2871 nt		2.54	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	GNT1	YOR320C	1476 nt		2.53	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	MSL5	YLR116W	1431 nt		2.53	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	YER121W	YER121W	345 nt		2.53	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	LSO2	YGR169C-A	279 nt		2.53	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	TMA22	YJR014W	597 nt		2.53	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	HIT1	YJR055W	495 nt		2.53	□□□□□ -2
IWR1	Q07532	GIS1	YDR096W	2685 nt		2.53	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	SCP160	YJL080C	3669 nt		2.53	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	YEL043W	YEL043W	2871 nt		2.52	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	SGS1	YMR190C	4344 nt		2.52	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	YER023C-A	YER023C-A	213 nt		2.52	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	RTC6	YPL183W-A	282 nt		2.52	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	SWA2	YDR320C	2007 nt		2.52	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	TAE2	YPL009C	3117 nt		2.52	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	SMY2	YBR172C	2223 nt		2.52	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	KAR3	YPR141C	2190 nt		2.51	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	TOP2	YNL088W	4287 nt		2.51	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	BFA1	YJR053W	1725 nt		2.51	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	NOP10	YHR072W-A	177 nt		2.51	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	YBL071C	YBL071C	309 nt		2.51	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	YPL238C	YPL238C	390 nt		2.51	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	RUD3	YOR216C	1455 nt		2.51	□□□□□ -2.01
IWR1	Q07532	TOR1	YJR066W	7413 nt		2.51	□□□□□ -2.01

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.2 ms