Protein–RNA interactions for Protein: Q02785

PDR12, ATP-dependent permease PDR12, yeastyeast

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR12Q02785 NNF2YGR089W 2811 nt0.17□□□□□ -2.38
PDR12Q02785 YDR042CYDR042C 603 nt0.17□□□□□ -2.38
PDR12Q02785 RNH202YDR279W 1053 nt0.17□□□□□ -2.38
PDR12Q02785 IRC23YOR044W 474 nt0.17□□□□□ -2.38
PDR12Q02785 SWT1YOR166C 1377 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR12Q02785 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR12Q02785 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR12Q02785 HOP2YGL033W 657 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR12Q02785 COF1YLL050C 432 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR12Q02785 YOL035CYOL035C 303 nt0.16□□□□□ -2.38
PDR12Q02785 NUT1YGL151W 3399 nt0.15□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 RRT7YLL030C 342 nt0.15□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 MRPL50YNR022C 420 nt0.15□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 STB6YKL072W 2301 nt0.14□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 SRL4YPL033C 846 nt0.14□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 UTP10YJL109C 5310 nt0.14□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.14□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 POL4YCR014C 1749 nt0.14□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 COS7YDL248W 1152 nt0.13□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.13□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 IRC19YLL033W 693 nt0.13□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 SPC2YML055W 537 nt0.13□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 CTL1YMR180C 963 nt0.13□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 YPL035CYPL035C 348 nt0.13□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 DUO1YGL061C 744 nt0.13□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 RPS24BYIL069C 408 nt0.13□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 FYV6YNL133C 522 nt0.13□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt0.13□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 SEC5YDR166C 2916 nt0.12□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 YDL157CYDL157C 357 nt0.12□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.12□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 MZM1YDR493W 372 nt0.11□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 YEA4YEL004W 1029 nt0.11□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 TIM21YGR033C 720 nt0.11□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 CMC2YBL059C-A 330 nt0.11□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 SHE3YBR130C 1278 nt0.11□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 URB1YKL014C 5295 nt0.11□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 TRM12YML005W 1389 nt0.1□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 TSA2YDR453C 591 nt0.1□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 REX3YLR107W 1215 nt0.1□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 SFM1YOR021C 642 nt0.1□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 AIM9YER080W 1884 nt0.1□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 YCR015CYCR015C 954 nt0.09□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 PEX34YCL056C 435 nt0.09□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 SMY1YKL079W 1971 nt0.09□□□□□ -2.39
PDR12Q02785 ULI1YFR026C 510 nt0.08□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YMR181CYMR181C 465 nt0.08□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 HDA3YPR179C 1968 nt0.08□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 VMA7YGR020C 357 nt0.08□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 ECM12YHR021W-A 456 nt0.08□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 CPR3YML078W 549 nt0.08□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 CYB5YNL111C 363 nt0.08□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 CCL1YPR025C 1182 nt0.08□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YDL206WYDL206W 2289 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 PES4YFR023W 1836 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 NUP120YKL057C 3114 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YDR355CYDR355C 303 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YFR054CYFR054C 579 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 SPC42YKL042W 1092 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YLR400WYLR400W 474 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 NBP1YLR457C 960 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 PRM6YML047C 1059 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 MER1YNL210W 813 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 ACA1YER045C 1470 nt0.07□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 MED11YMR112C 396 nt0.06□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 snR191snR191 274 nt0.06□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 AEP3YPL005W 1821 nt0.05□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 GLG1YKR058W 1851 nt0.05□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YFR056CYFR056C 369 nt0.05□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YOL050CYOL050C 321 nt0.05□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt0.04□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YIL141WYIL141W 390 nt0.04□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 SDL1YIL167W 633 nt0.04□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YLL020CYLL020C 306 nt0.04□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 RPL32YBL092W 393 nt0.04□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 UAF30YOR295W 687 nt0.04□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 RTR1YER139C 681 nt0.03□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 ATG10YLL042C 504 nt0.03□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 RPL6BYLR448W 531 nt0.03□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.03□□□□□ -2.4
PDR12Q02785 GDS1YOR355W 1569 nt0.03□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 SLU7YDR088C 1149 nt0.03□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 YDR286CYDR286C 345 nt0.03□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 LRS4YDR439W 1044 nt0.03□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 GIC1YHR061C 945 nt0.03□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 SPO74YGL170C 1242 nt0.02□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 RPL37AYLR185W 267 nt0.02□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 YNL226WYNL226W 411 nt0.02□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 IRC14YOR135C 342 nt0.02□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 DXO1YDR370C 1329 nt0.02□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 SPT21YMR179W 2277 nt0.01□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 ENV11YGR071C 2583 nt0.01□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 PRM8YGL053W 714 nt0.01□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 EPT1YHR123W 1176 nt0.01□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 SWS2YNL081C 432 nt0.01□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 YNR068CYNR068C 819 nt0.01□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt0.01□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 DIG2YDR480W 972 nt0□□□□□ -2.41
PDR12Q02785 ARK1YNL020C 1917 nt0□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42 ms