Protein–RNA interactions for Protein: P40489

XBP1, Transcriptional repressor XBP1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XBP1P40489 MSH2YOL090W 2895 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 ROG1YGL144C 2058 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 RAD61YDR014W 1944 nt2.6□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YPP1YGR198W 2454 nt2.6□□□□□ -1.99
XBP1P40489 NMD2YHR077C 3270 nt2.6□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.6□□□□□ -1.99
XBP1P40489 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.6□□□□□ -1.99
XBP1P40489 UBP14YBR058C 2346 nt2.59□□□□□ -1.99
XBP1P40489 NUP82YJL061W 2142 nt2.59□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.59□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YHL005CYHL005C 393 nt2.59□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YIL058WYIL058W 285 nt2.59□□□□□ -1.99
XBP1P40489 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.59□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YBR064WYBR064W 429 nt2.59□□□□□ -1.99
XBP1P40489 SWD3YBR175W 948 nt2.59□□□□□ -1.99
XBP1P40489 CDC24YAL041W 2565 nt2.59□□□□□ -1.99
XBP1P40489 TAO3YIL129C 7131 nt2.59□□□□□ -2
XBP1P40489 ROM1YGR070W 3468 nt2.59□□□□□ -2
XBP1P40489 HFM1YGL251C 3564 nt2.59□□□□□ -2
XBP1P40489 PMR1YGL167C 2853 nt2.59□□□□□ -2
XBP1P40489 GYL1YMR192W 2163 nt2.59□□□□□ -2
XBP1P40489 YNL034WYNL034W 1839 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 VPS41YDR080W 2979 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 SNQ2YDR011W 4506 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 ORC1YML065W 2745 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 DUF1YOL087C 3351 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 YDR048CYDR048C 315 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 RPL6AYML073C 531 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 YOR170WYOR170W 306 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 YPL182CYPL182C 384 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 snR191snR191 274 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 ATG13YPR185W 2217 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 YPK1YKL126W 2043 nt2.58□□□□□ -2
XBP1P40489 YCG1YDR325W 3108 nt2.57□□□□□ -2
XBP1P40489 DBP6YNR038W 1890 nt2.57□□□□□ -2
XBP1P40489 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.57□□□□□ -2
XBP1P40489 HTB2YBL002W 396 nt2.57□□□□□ -2
XBP1P40489 RPS18BYML026C 441 nt2.57□□□□□ -2
XBP1P40489 YNL338WYNL338W 159 nt2.57□□□□□ -2
XBP1P40489 BNI4YNL233W 2679 nt2.57□□□□□ -2
XBP1P40489 TSC11YER093C 4293 nt2.57□□□□□ -2
XBP1P40489 NMA111YNL123W 2994 nt2.57□□□□□ -2
XBP1P40489 NAB6YML117W 3405 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 CHS3YBR023C 3498 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 AIM9YER080W 1884 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 GCD6YDR211W 2139 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 FRE2YKL220C 2136 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 GYP7YDL234C 2241 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 ECM21YBL101C 3354 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 DYN2YDR424C 279 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 YIL102CYIL102C 306 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 HSK3YKL138C-A 210 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 YKR033CYKR033C 426 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 RPL32YBL092W 393 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 RSN1YMR266W 2862 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 REV1YOR346W 2958 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 NPR2YEL062W 1848 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 YJL181WYJL181W 1836 nt2.56□□□□□ -2
XBP1P40489 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YER138CYER138C 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YER160CYER160C 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YJR027WYJR027W 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YML039WYML039W 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YML045WYML045W 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YMR050CYMR050C 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 VPS3YDR495C 3036 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 MSB2YGR014W 3921 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 BIT61YJL058C 1632 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 FUS1YCL027W 1539 nt2.55□□□□□ -2
XBP1P40489 MSS11YMR164C 2277 nt2.54□□□□□ -2
XBP1P40489 TFC4YGR047C 3078 nt2.54□□□□□ -2
XBP1P40489 CCW14YLR390W-A 717 nt2.54□□□□□ -2
XBP1P40489 ESF2YNR054C 951 nt2.54□□□□□ -2
XBP1P40489 COG8YML071C 1824 nt2.54□□□□□ -2
XBP1P40489 BRO1YPL084W 2535 nt2.53□□□□□ -2
XBP1P40489 YPL216WYPL216W 3309 nt2.53□□□□□ -2
XBP1P40489 snR79snR79 84 nt2.53□□□□□ -2
XBP1P40489 YIL032CYIL032C 357 nt2.53□□□□□ -2
XBP1P40489 YNL170WYNL170W 396 nt2.53□□□□□ -2
XBP1P40489 MNT3YIL014W 1893 nt2.53□□□□□ -2
XBP1P40489 ECM5YMR176W 4236 nt2.53□□□□□ -2
XBP1P40489 ITC1YGL133W 3795 nt2.53□□□□□ -2.01
XBP1P40489 BUB1YGR188C 3066 nt2.53□□□□□ -2.01
XBP1P40489 PRP8YHR165C 7242 nt2.52□□□□□ -2.01
XBP1P40489 TFB1YDR311W 1929 nt2.52□□□□□ -2.01
XBP1P40489 VPS64YDR200C 1815 nt2.52□□□□□ -2.01
XBP1P40489 CAF120YNL278W 3183 nt2.52□□□□□ -2.01
XBP1P40489 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.52□□□□□ -2.01
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