Protein–RNA interactions for Protein: P40479

SDP1, Dual-specificity protein phosphatase SDP1, yeastyeast

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SDP1P40479 VAS1YGR094W 3315 nt2.9□□□□□ -1.95
SDP1P40479 SNQ2YDR011W 4506 nt2.89□□□□□ -1.95
SDP1P40479 DYN1YKR054C 12279 nt2.89□□□□□ -1.95
SDP1P40479 MCD1YDL003W 1701 nt2.89□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YFH1YDL120W 525 nt2.89□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.89□□□□□ -1.95
SDP1P40479 HCS1YKL017C 2052 nt2.88□□□□□ -1.95
SDP1P40479 GIN4YDR507C 3429 nt2.88□□□□□ -1.95
SDP1P40479 Q0092Q0092 141 nt2.88□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YIL032CYIL032C 357 nt2.88□□□□□ -1.95
SDP1P40479 RPS27AYKL156W 249 nt2.88□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.88□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.88□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.88□□□□□ -1.95
SDP1P40479 SHQ1YIL104C 1524 nt2.88□□□□□ -1.95
SDP1P40479 TFC1YBR123C 1950 nt2.87□□□□□ -1.95
SDP1P40479 CDC20YGL116W 1833 nt2.87□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YGL024WYGL024W 336 nt2.87□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YBR197CYBR197C 654 nt2.87□□□□□ -1.95
SDP1P40479 snR42snR42 351 nt2.87□□□□□ -1.95
SDP1P40479 DIS3YOL021C 3006 nt2.87□□□□□ -1.95
SDP1P40479 BAS1YKR099W 2436 nt2.87□□□□□ -1.95
SDP1P40479 RBK1YCR036W 1002 nt2.86□□□□□ -1.95
SDP1P40479 APQ12YIL040W 417 nt2.86□□□□□ -1.95
SDP1P40479 PHS1YJL097W 654 nt2.86□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.86□□□□□ -1.95
SDP1P40479 SAR1YPL218W 573 nt2.86□□□□□ -1.95
SDP1P40479 FUN30YAL019W 3396 nt2.86□□□□□ -1.95
SDP1P40479 AKR1YDR264C 2295 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 ISD11YER048W-A 285 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YHL041WYHL041W 450 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YHL042WYHL042W 453 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 RPL36AYMR194W 303 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 MRPL33YMR286W 261 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YCL023CYCL023C 348 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 IPT1YDR072C 1584 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 STE6YKL209C 3873 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YJL070CYJL070C 2667 nt2.85□□□□□ -1.95
SDP1P40479 DUF1YOL087C 3351 nt2.84□□□□□ -1.95
SDP1P40479 PSY2YNL201C 2577 nt2.84□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.84□□□□□ -1.95
SDP1P40479 PAM16YJL104W 450 nt2.84□□□□□ -1.95
SDP1P40479 RTC6YPL183W-A 282 nt2.84□□□□□ -1.95
SDP1P40479 YBR064WYBR064W 429 nt2.84□□□□□ -1.95
SDP1P40479 COG8YML071C 1824 nt2.84□□□□□ -1.96
SDP1P40479 RIM20YOR275C 1986 nt2.83□□□□□ -1.96
SDP1P40479 CHS2YBR038W 2892 nt2.83□□□□□ -1.96
SDP1P40479 YMR317WYMR317W 3423 nt2.83□□□□□ -1.96
SDP1P40479 snR76snR76 109 nt2.83□□□□□ -1.96
SDP1P40479 DLS1YJL065C 504 nt2.83□□□□□ -1.96
SDP1P40479 YLR053CYLR053C 327 nt2.83□□□□□ -1.96
SDP1P40479 RGM1YMR182C 636 nt2.83□□□□□ -1.96
SDP1P40479 IES4YOR189W 351 nt2.83□□□□□ -1.96
SDP1P40479 CSR2YPR030W 3366 nt2.83□□□□□ -1.96
SDP1P40479 RLI1YDR091C 1827 nt2.83□□□□□ -1.96
SDP1P40479 TAF2YCR042C 4224 nt2.83□□□□□ -1.96
SDP1P40479 RIF1YBR275C 5751 nt2.82□□□□□ -1.96
SDP1P40479 ORC1YML065W 2745 nt2.82□□□□□ -1.96
SDP1P40479 DOT6YER088C 2013 nt2.82□□□□□ -1.96
SDP1P40479 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.82□□□□□ -1.96
SDP1P40479 LSM7YNL147W 348 nt2.82□□□□□ -1.96
SDP1P40479 FLO1YAR050W 4614 nt2.81□□□□□ -1.96
SDP1P40479 MPH1YIR002C 2982 nt2.81□□□□□ -1.96
SDP1P40479 YIL059CYIL059C 366 nt2.81□□□□□ -1.96
SDP1P40479 RPA34YJL148W 702 nt2.81□□□□□ -1.96
SDP1P40479 YJL182CYJL182C 318 nt2.81□□□□□ -1.96
SDP1P40479 SNT1YCR033W 3681 nt2.81□□□□□ -1.96
SDP1P40479 LRG1YDL240W 3054 nt2.8□□□□□ -1.96
SDP1P40479 TOM1YDR457W 9807 nt2.8□□□□□ -1.96
SDP1P40479 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.8□□□□□ -1.96
SDP1P40479 PSK1YAL017W 4071 nt2.8□□□□□ -1.96
SDP1P40479 MOT1YPL082C 5604 nt2.79□□□□□ -1.96
SDP1P40479 DNL4YOR005C 2835 nt2.79□□□□□ -1.96
SDP1P40479 NET1YJL076W 3570 nt2.79□□□□□ -1.96
SDP1P40479 SNU114YKL173W 3027 nt2.79□□□□□ -1.96
SDP1P40479 YGL069CYGL069C 465 nt2.79□□□□□ -1.96
SDP1P40479 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.79□□□□□ -1.96
SDP1P40479 GRX8YLR364W 330 nt2.79□□□□□ -1.96
SDP1P40479 TSC11YER093C 4293 nt2.79□□□□□ -1.96
SDP1P40479 SAK1YER129W 3429 nt2.78□□□□□ -1.96
SDP1P40479 SGD1YLR336C 2700 nt2.78□□□□□ -1.96
SDP1P40479 NCL1YBL024W 2055 nt2.78□□□□□ -1.96
SDP1P40479 CHO2YGR157W 2610 nt2.78□□□□□ -1.96
SDP1P40479 NAB3YPL190C 2409 nt2.78□□□□□ -1.96
SDP1P40479 snR55snR55 98 nt2.78□□□□□ -1.96
SDP1P40479 YGR151CYGR151C 336 nt2.78□□□□□ -1.96
SDP1P40479 YOL160WYOL160W 342 nt2.78□□□□□ -1.96
SDP1P40479 YLL032CYLL032C 2478 nt2.78□□□□□ -1.96
SDP1P40479 DSE4YNR067C 3354 nt2.78□□□□□ -1.96
SDP1P40479 DFG16YOR030W 1860 nt2.77□□□□□ -1.97
SDP1P40479 NPC2YDL046W 522 nt2.77□□□□□ -1.97
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