Protein–RNA interactions for Protein: P38192

RRT1, Regulator of rDNA transcription protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT1P38192 RAD6YGL058W 519 nt1.03□□□□□ -2.24
RRT1P38192 YJL015CYJL015C 285 nt1.03□□□□□ -2.24
RRT1P38192 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt1.03□□□□□ -2.24
RRT1P38192 ERG29YMR134W 714 nt1.03□□□□□ -2.24
RRT1P38192 PET123YOR158W 957 nt1.03□□□□□ -2.24
RRT1P38192 SNC2YOR327C 348 nt1.03□□□□□ -2.24
RRT1P38192 PIK1YNL267W 3201 nt1.03□□□□□ -2.24
RRT1P38192 HTB1YDR224C 396 nt1.02□□□□□ -2.25
RRT1P38192 BUD26YDR241W 288 nt1.02□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt1.02□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YLR302CYLR302C 363 nt1.02□□□□□ -2.25
RRT1P38192 TIF11YMR260C 462 nt1.02□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YOR105WYOR105W 327 nt1.02□□□□□ -2.25
RRT1P38192 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt1.01□□□□□ -2.25
RRT1P38192 SPE1YKL184W 1401 nt1.01□□□□□ -2.25
RRT1P38192 MNL2YLR057W 2550 nt1.01□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.01□□□□□ -2.25
RRT1P38192 VPS74YDR372C 1038 nt1.01□□□□□ -2.25
RRT1P38192 LSM12YHR121W 564 nt1.01□□□□□ -2.25
RRT1P38192 PGA1YNL158W 597 nt1.01□□□□□ -2.25
RRT1P38192 RPL33BYOR234C 324 nt1.01□□□□□ -2.25
RRT1P38192 DOT6YER088C 2013 nt1.01□□□□□ -2.25
RRT1P38192 NCA2YPR155C 1851 nt1.01□□□□□ -2.25
RRT1P38192 CIC1YHR052W 1131 nt1□□□□□ -2.25
RRT1P38192 POL32YJR043C 1053 nt1□□□□□ -2.25
RRT1P38192 SPR2YOR214C 711 nt1□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt1□□□□□ -2.25
RRT1P38192 SMC4YLR086W 4257 nt1□□□□□ -2.25
RRT1P38192 MLH3YPL164C 2148 nt1□□□□□ -2.25
RRT1P38192 LAA1YJL207C 6045 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 CDC36YDL165W 576 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 RSM28YDR494W 1086 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 RPL29YFR032C-A 180 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YGL042CYGL042C 306 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 GEP7YGL057C 864 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 VOA1YGR106C 798 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 CUP1-1YHR053C 186 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 CUP1-2YHR055C 186 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 PEP8YJL053W 1140 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 IRC19YLL033W 693 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 MTG1YMR097C 1104 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 EGD1YPL037C 474 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 ATP15YPL271W 189 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 NOT5YPR072W 1683 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 MSC6YOR354C 2079 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 ALK1YGL021W 2283 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 PBY1YBR094W 2262 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 RSM22YKL155C 1887 nt0.99□□□□□ -2.25
RRT1P38192 AHC1YOR023C 1701 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 EST2YLR318W 2655 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 ADR1YDR216W 3972 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 RVS161YCR009C 798 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YDR248CYDR248C 582 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 SEC28YIL076W 891 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YJL022WYJL022W 309 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 BET4YJL031C 984 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YBL083CYBL083C 426 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 PHO80YOL001W 882 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 RPB11YOL005C 363 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 RTC6YPL183W-A 282 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 RLM1YPL089C 2031 nt0.98□□□□□ -2.25
RRT1P38192 MMS22YLR320W 4365 nt0.97□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YCR043CYCR043C 384 nt0.97□□□□□ -2.25
RRT1P38192 DAD1YDR016C 285 nt0.97□□□□□ -2.25
RRT1P38192 BNA7YDR428C 786 nt0.97□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YIL082WYIL082W 873 nt0.97□□□□□ -2.25
RRT1P38192 RPC25YKL144C 639 nt0.97□□□□□ -2.25
RRT1P38192 YNL226WYNL226W 411 nt0.97□□□□□ -2.25
RRT1P38192 ROX1YPR065W 1107 nt0.97□□□□□ -2.25
RRT1P38192 GPX2YBR244W 489 nt0.97□□□□□ -2.25
RRT1P38192 GUP1YGL084C 1683 nt0.97□□□□□ -2.25
RRT1P38192 SPO75YLL005C 2607 nt0.96□□□□□ -2.26
RRT1P38192 MTC7YEL033W 420 nt0.96□□□□□ -2.26
RRT1P38192 LOC1YFR001W 615 nt0.96□□□□□ -2.26
RRT1P38192 HYM1YKL189W 1200 nt0.96□□□□□ -2.26
RRT1P38192 COF1YLL050C 432 nt0.96□□□□□ -2.26
RRT1P38192 LCL2YLR104W 396 nt0.96□□□□□ -2.26
RRT1P38192 GPN3YLR243W 819 nt0.96□□□□□ -2.26
RRT1P38192 YBR287WYBR287W 1284 nt0.96□□□□□ -2.26
RRT1P38192 RAD9YDR217C 3930 nt0.96□□□□□ -2.26
RRT1P38192 CMC1YKL137W 336 nt0.95□□□□□ -2.26
RRT1P38192 YLR149CYLR149C 2193 nt0.95□□□□□ -2.26
RRT1P38192 KAP122YGL016W 3246 nt0.95□□□□□ -2.26
RRT1P38192 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt0.94□□□□□ -2.26
RRT1P38192 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.94□□□□□ -2.26
RRT1P38192 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.94□□□□□ -2.26
RRT1P38192 RRT15YLR162W-A 189 nt0.94□□□□□ -2.26
RRT1P38192 YOR152CYOR152C 771 nt0.94□□□□□ -2.26
RRT1P38192 SPT7YBR081C 3999 nt0.94□□□□□ -2.26
RRT1P38192 AZF1YOR113W 2745 nt0.93□□□□□ -2.26
RRT1P38192 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.93□□□□□ -2.26
RRT1P38192 LAG1YHL003C 1236 nt0.93□□□□□ -2.26
RRT1P38192 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.93□□□□□ -2.26
RRT1P38192 COX3Q0275 810 nt0.93□□□□□ -2.26
RRT1P38192 VPS55YJR044C 423 nt0.93□□□□□ -2.26
RRT1P38192 YBL062WYBL062W 381 nt0.93□□□□□ -2.26
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