Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GMIPQ9P107 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
GMIPQ9P107 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GMIPQ9P107 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GMIPQ9P107 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMIPQ9P107 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMIPQ9P107 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GMIPQ9P107 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms