Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NECAP2Q9NVZ3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms