Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC93Q567U6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms