Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME3Q16798 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ME3Q16798 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME3Q16798 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME3Q16798 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME3Q16798 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME3Q16798 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME3Q16798 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME3Q16798 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME3Q16798 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME3Q16798 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME3Q16798 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME3Q16798 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME3Q16798 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME3Q16798 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME3Q16798 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME3Q16798 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME3Q16798 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME3Q16798 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME3Q16798 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME3Q16798 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME3Q16798 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME3Q16798 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME3Q16798 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME3Q16798 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME3Q16798 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ME3Q16798 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ME3Q16798 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms