Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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