Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 INO80YGL150C 4470 nt2.07□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 RTT101YJL047C 2529 nt2.07□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YNL034WYNL034W 1839 nt2.06□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YFR016CYFR016C 3702 nt2.06□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 EMP24YGL200C 612 nt2.06□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 CIC1YHR052W 1131 nt2.06□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 HRI1YLR301W 735 nt2.05□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 BER1YLR412W 825 nt2.05□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 SIP18YMR175W 240 nt2.05□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 ATP19YOL077W-A 207 nt2.05□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 NSL1YPL233W 651 nt2.05□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 LEU3YLR451W 2661 nt2.05□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 SSF1YHR066W 1362 nt2.05□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 RPF1YHR088W 888 nt2.04□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YKL044WYKL044W 321 nt2.04□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 VPH1YOR270C 2523 nt2.04□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 IPT1YDR072C 1584 nt2.03□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 RAD6YGL058W 519 nt2.03□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 RNR4YGR180C 1038 nt2.03□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 PEP8YJL053W 1140 nt2.03□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 FYV7YLR068W 456 nt2.03□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 RMP1YLR145W 606 nt2.03□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 ARV1YLR242C 966 nt2.03□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.03□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 ATP15YPL271W 189 nt2.03□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 ELG1YOR144C 2376 nt2.03□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 RTT107YHR154W 3213 nt2.03□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YMR045CYMR045C 5268 nt2.03□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 PRK1YIL095W 2433 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 ASG1YIL130W 2895 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 BI4Q0120 1917 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YGL015CYGL015C 393 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YGR045CYGR045C 363 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 RRF1YHR038W 693 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 PHO80YOL001W 882 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 OST2YOR103C 393 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 GAL7YBR018C 1101 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YPL068CYPL068C 882 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 TRS20YBR254C 528 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 VPS8YAL002W 3825 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 MET18YIL128W 3099 nt2.02□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 RUD3YOR216C 1455 nt2.01□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YDR220CYDR220C 294 nt2.01□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YLR456WYLR456W 615 nt2.01□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YBL012CYBL012C 402 nt2.01□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 BUD2YKL092C 3315 nt2.01□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 TRL1YJL087C 2484 nt2□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 ATG9YDL149W 2994 nt2□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 SPO13YHR014W 876 nt2□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YKR051WYKR051W 1257 nt2□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 CTK3YML112W 891 nt2□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 ICY1YMR195W 384 nt2□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 IRC16YPR038W 360 nt2□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YCL023CYCL023C 348 nt2□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 SET2YJL168C 2202 nt2□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 SSQ1YLR369W 1974 nt1.99□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 ECM5YMR176W 4236 nt1.99□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 UBR2YLR024C 5619 nt1.99□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 GYP5YPL249C 2685 nt1.99□□□□□ -2.09
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LDB17Q12342 RPL29YFR032C-A 180 nt1.99□□□□□ -2.09
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LDB17Q12342 YNL122CYNL122C 348 nt1.99□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 PUT3YKL015W 2940 nt1.99□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 NIC96YFR002W 2520 nt1.98□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.98□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 FMP16YDR070C 282 nt1.98□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 TSA2YDR453C 591 nt1.98□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 MPH1YIR002C 2982 nt1.98□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 HYR1YIR037W 492 nt1.98□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 EAF6YJR082C 342 nt1.98□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 SHE2YKL130C 741 nt1.98□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 RPS7BYNL096C 573 nt1.98□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt1.98□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 AGC1YPR021C 2709 nt1.98□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 PDR8YLR266C 2106 nt1.97□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 NDD1YOR372C 1665 nt1.97□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YDL118WYDL118W 381 nt1.97□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 GPI8YDR331W 1236 nt1.97□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 MTC7YEL033W 420 nt1.97□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YEL057CYEL057C 702 nt1.97□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.97□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.97□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 RPL9AYGL147C 576 nt1.97□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 CDC60YPL160W 3273 nt1.97□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 DPB11YJL090C 2295 nt1.97□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 SPR3YGR059W 1539 nt1.96□□□□□ -2.09
LDB17Q12342 UBP11YKR098C 2154 nt1.96□□□□□ -2.1
LDB17Q12342 ECM25YJL201W 1800 nt1.96□□□□□ -2.1
LDB17Q12342 NEO1YIL048W 3456 nt1.96□□□□□ -2.1
LDB17Q12342 MET32YDR253C 576 nt1.96□□□□□ -2.1
LDB17Q12342 MXR1YER042W 555 nt1.96□□□□□ -2.1
LDB17Q12342 YFR056CYFR056C 369 nt1.96□□□□□ -2.1
LDB17Q12342 YPS5YGL259W 498 nt1.96□□□□□ -2.1
LDB17Q12342 TIM10YHR005C-A 282 nt1.96□□□□□ -2.1
LDB17Q12342 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.96□□□□□ -2.1
LDB17Q12342 YIL058WYIL058W 285 nt1.96□□□□□ -2.1
LDB17Q12342 RPL40AYIL148W 387 nt1.96□□□□□ -2.1
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