Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 GCV2YMR189W 3105 nt3.33□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 AAD16YFL057C 459 nt3.33□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 NCE101YJL205C 162 nt3.33□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 YOR146WYOR146W 306 nt3.33□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 ATP15YPL271W 189 nt3.33□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 snR43snR43 209 nt3.33□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 PDR3YBL005W 2931 nt3.33□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 YJL181WYJL181W 1836 nt3.32□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 RRM3YHR031C 2172 nt3.32□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 ASG1YIL130W 2895 nt3.32□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 SSN2YDR443C 4263 nt3.32□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 BCK1YJL095W 4437 nt3.32□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 RIF1YBR275C 5751 nt3.31□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 RPL25YOL127W 429 nt3.31□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 RPL36BYPL249C-A 303 nt3.31□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 FIR1YER032W 2631 nt3.31□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 YJR011CYJR011C 786 nt3.3□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 COX7YMR256C 183 nt3.3□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.3□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 YOR121CYOR121C 306 nt3.3□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 VPS52YDR484W 1926 nt3.3□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 SLN1YIL147C 3663 nt3.3□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 FKS3YMR306W 5358 nt3.29□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 KSP1YHR082C 3090 nt3.29□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 UBP14YBR058C 2346 nt3.29□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 RPS20YHL015W 366 nt3.29□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 RPL40AYIL148W 387 nt3.29□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 RNP1YLL046C 750 nt3.29□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 CCW14YLR390W-A 717 nt3.29□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 FPR1YNL135C 345 nt3.29□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 ATG13YPR185W 2217 nt3.29□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 COX1Q0045 1605 nt3.29□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 SPO71YDR104C 3738 nt3.29□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 NEW1YPL226W 3591 nt3.28□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 MSS11YMR164C 2277 nt3.28□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 TFC4YGR047C 3078 nt3.28□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 AYT1YLL063C 1425 nt3.28□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 YDL041WYDL041W 354 nt3.28□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 YER137W-AYER137W-A 306 nt3.28□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 URM1YIL008W 300 nt3.28□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 RPS22BYLR367W 393 nt3.28□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 YML003WYML003W 873 nt3.28□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 CRS5YOR031W 210 nt3.28□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 YPR089WYPR089W 2667 nt3.28□□□□□ -1.88
NSE3Q05541 YGR035CYGR035C 351 nt3.27□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 AYR1YIL124W 894 nt3.27□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 PTP3YER075C 2787 nt3.26□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt3.26□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 PHD1YKL043W 1101 nt3.26□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 YNL010WYNL010W 726 nt3.26□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 VPS41YDR080W 2979 nt3.26□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 RPO41YFL036W 4056 nt3.26□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 SEC26YDR238C 2922 nt3.25□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 YBL071CYBL071C 309 nt3.25□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 EGD1YPL037C 474 nt3.25□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 YGR067CYGR067C 2415 nt3.25□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 PRP6YBR055C 2700 nt3.25□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 DOA4YDR069C 2781 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 UTP14YML093W 2700 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 MZM1YDR493W 372 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 YLR031WYLR031W 561 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 RPS18BYML026C 441 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 COQ10YOL008W 624 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 YBL108WYBL108W 306 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 YPL238CYPL238C 390 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 ROX1YPR065W 1107 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 IRC10YOL015W 1761 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 AXL1YPR122W 3627 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 SDC25YLL016W 3147 nt3.24□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.23□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 YIL174WYIL174W 228 nt3.23□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.23□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 MSL5YLR116W 1431 nt3.23□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 ATP3YBR039W 936 nt3.23□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 snR79snR79 84 nt3.22□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 RTT102YGR275W 474 nt3.22□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 EMC6YLL014W 327 nt3.22□□□□□ -1.89
NSE3Q05541 CAF120YNL278W 3183 nt3.21□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 RCY1YJL204C 2523 nt3.21□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YDR186CYDR186C 2634 nt3.21□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 TMA22YJR014W 597 nt3.21□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 PTC5YOR090C 1719 nt3.21□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 ECM29YHL030W 5607 nt3.21□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 GIN4YDR507C 3429 nt3.21□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 CYR1YJL005W 6081 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YER138CYER138C 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YER160CYER160C 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YJR027WYJR027W 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YML039WYML039W 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YML045WYML045W 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YMR050CYMR050C 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
NSE3Q05541 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt3.2□□□□□ -1.9
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