Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORDQ00796 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SORDQ00796 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORDQ00796 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORDQ00796 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORDQ00796 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms