Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3KRW8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3KRW8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3KRW8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms