Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms