Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.17■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RPRD2Q5VT52 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RPRD2Q5VT52 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RPRD2Q5VT52 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
RPRD2Q5VT52 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RPRD2Q5VT52 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
RPRD2Q5VT52 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RPRD2Q5VT52 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
RPRD2Q5VT52 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
RPRD2Q5VT52 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
RPRD2Q5VT52 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.05■■■■□ 3.84
RPRD2Q5VT52 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RPRD2Q5VT52 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
RPRD2Q5VT52 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
RPRD2Q5VT52 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RPRD2Q5VT52 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
RPRD2Q5VT52 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
RPRD2Q5VT52 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
RPRD2Q5VT52 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
RPRD2Q5VT52 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39■■■■□ 3.83
RPRD2Q5VT52 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
RPRD2Q5VT52 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
RPRD2Q5VT52 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
RPRD2Q5VT52 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RPRD2Q5VT52 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RPRD2Q5VT52 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RPRD2Q5VT52 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RPRD2Q5VT52 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RPRD2Q5VT52 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RPRD2Q5VT52 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RPRD2Q5VT52 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
RPRD2Q5VT52 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
RPRD2Q5VT52 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
RPRD2Q5VT52 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
RPRD2Q5VT52 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RPRD2Q5VT52 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RPRD2Q5VT52 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RPRD2Q5VT52 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RPRD2Q5VT52 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
RPRD2Q5VT52 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RPRD2Q5VT52 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
RPRD2Q5VT52 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
RPRD2Q5VT52 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RPRD2Q5VT52 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
RPRD2Q5VT52 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
RPRD2Q5VT52 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RPRD2Q5VT52 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
RPRD2Q5VT52 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RPRD2Q5VT52 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RPRD2Q5VT52 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
RPRD2Q5VT52 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
RPRD2Q5VT52 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
RPRD2Q5VT52 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms