Protein–RNA interactions for Protein: Q12439

TY2A-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR1Q12439 RSC4YKR008W 1878 nt8.37□□□□□ -1.07
TY2A-OR1Q12439 SGA1YIL099W 1650 nt8.37□□□□□ -1.07
TY2A-OR1Q12439 HIS2YFR025C 1008 nt8.36□□□□□ -1.07
TY2A-OR1Q12439 MHF1YOL086W-A 273 nt8.36□□□□□ -1.07
TY2A-OR1Q12439 GID8YMR135C 1368 nt8.35□□□□□ -1.07
TY2A-OR1Q12439 YJR114WYJR114W 393 nt8.34□□□□□ -1.07
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TY2A-OR1Q12439 SPS100YHR139C 981 nt8.33□□□□□ -1.08
TY2A-OR1Q12439 POT1YIL160C 1254 nt8.33□□□□□ -1.08
TY2A-OR1Q12439 YMR262WYMR262W 942 nt8.32□□□□□ -1.08
TY2A-OR1Q12439 UGP1YKL035W 1500 nt8.31□□□□□ -1.08
TY2A-OR1Q12439 SAC7YDR389W 1965 nt8.31□□□□□ -1.08
TY2A-OR1Q12439 YKL133CYKL133C 1392 nt8.3□□□□□ -1.08
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TY2A-OR1Q12439 YGL114WYGL114W 2178 nt8.28□□□□□ -1.08
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TY2A-OR1Q12439 ENO2YHR174W 1314 nt8.23□□□□□ -1.09
TY2A-OR1Q12439 TUB4YLR212C 1422 nt8.22□□□□□ -1.09
TY2A-OR1Q12439 MET2YNL277W 1461 nt8.22□□□□□ -1.09
TY2A-OR1Q12439 APS2YJR058C 444 nt8.22□□□□□ -1.09
TY2A-OR1Q12439 RPD3YNL330C 1302 nt8.22□□□□□ -1.09
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TY2A-OR1Q12439 PAB1YER165W 1734 nt8.2□□□□□ -1.1
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TY2A-OR1Q12439 CWP2YKL096W-A 279 nt8.14□□□□□ -1.11
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TY2A-OR1Q12439 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.96□□□□□ -1.14
TY2A-OR1Q12439 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.96□□□□□ -1.14
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