Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 SPS100YHR139C 981 nt10.2□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 MAS1YLR163C 1389 nt10.2□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 GSF2YML048W 1212 nt10.2□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 BET2YPR176C 978 nt10.2□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.19□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 DIG1YPL049C 1359 nt10.17□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 ENT4YLL038C 744 nt10.17□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 YBR232CYBR232C 360 nt10.17□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 QDR2YIL121W 1629 nt10.16□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 YJR114WYJR114W 393 nt10.16□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 YLR046CYLR046C 813 nt10.16□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 SEN2YLR105C 1134 nt10.16□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 LSB6YJL100W 1824 nt10.16□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 HEM14YER014W 1620 nt10.15□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 RFC1YOR217W 2586 nt10.15□□□□□ -0.78
SSF2Q12153 TUB4YLR212C 1422 nt10.15□□□□□ -0.79
SSF2Q12153 APS2YJR058C 444 nt10.13□□□□□ -0.79
SSF2Q12153 DTR1YBR180W 1719 nt10.13□□□□□ -0.79
SSF2Q12153 ARO8YGL202W 1503 nt10.12□□□□□ -0.79
SSF2Q12153 TVP23YDR084C 600 nt10.12□□□□□ -0.79
SSF2Q12153 ABZ2YMR289W 1125 nt10.11□□□□□ -0.79
SSF2Q12153 PAR32YDL173W 888 nt10.1□□□□□ -0.79
SSF2Q12153 NIF3YGL221C 867 nt10.1□□□□□ -0.79
SSF2Q12153 OPI3YJR073C 621 nt10.09□□□□□ -0.79
SSF2Q12153 KES1YPL145C 1305 nt10.08□□□□□ -0.8
SSF2Q12153 SAC7YDR389W 1965 nt10.08□□□□□ -0.8
SSF2Q12153 NAP1YKR048C 1254 nt10.08□□□□□ -0.8
SSF2Q12153 HOL1YNR055C 1761 nt10.08□□□□□ -0.8
SSF2Q12153 COQ8YGL119W 1506 nt10.07□□□□□ -0.8
SSF2Q12153 KRE1YNL322C 942 nt10.07□□□□□ -0.8
SSF2Q12153 ENO2YHR174W 1314 nt10.06□□□□□ -0.8
SSF2Q12153 YNR064CYNR064C 873 nt10.05□□□□□ -0.8
SSF2Q12153 YJL064WYJL064W 396 nt10.04□□□□□ -0.8
SSF2Q12153 GID8YMR135C 1368 nt10.03□□□□□ -0.8
SSF2Q12153 DLD3YEL071W 1491 nt10.01□□□□□ -0.81
SSF2Q12153 ELO1YJL196C 933 nt10□□□□□ -0.81
SSF2Q12153 ITR2YOL103W 1830 nt10□□□□□ -0.81
SSF2Q12153 ILV2YMR108W 2064 nt10□□□□□ -0.81
SSF2Q12153 SGA1YIL099W 1650 nt9.99□□□□□ -0.81
SSF2Q12153 AMF1YOR378W 1548 nt9.99□□□□□ -0.81
SSF2Q12153 SPE2YOL052C 1191 nt9.99□□□□□ -0.81
SSF2Q12153 IGD1YFR017C 588 nt9.98□□□□□ -0.81
SSF2Q12153 PAU19YMR325W 375 nt9.98□□□□□ -0.81
SSF2Q12153 TIP1YBR067C 633 nt9.98□□□□□ -0.81
SSF2Q12153 TPC1YGR096W 945 nt9.97□□□□□ -0.81
SSF2Q12153 HIS2YFR025C 1008 nt9.96□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 PUP1YOR157C 786 nt9.96□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 YKL133CYKL133C 1392 nt9.96□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 PCP1YGR101W 1041 nt9.95□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 NAS2YIL007C 663 nt9.95□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 MRS6YOR370C 1812 nt9.95□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 KEL3YPL263C 1956 nt9.95□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 LSR1LSR1 1175 nt9.94□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 NPP1YCR026C 2229 nt9.94□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 YHR219WYHR219W 1875 nt9.93□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 PUS7YOR243C 2031 nt9.93□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 YDR306CYDR306C 1437 nt9.92□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 VMA11YPL234C 495 nt9.92□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 THP3YPR045C 1413 nt9.9□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 LEU2YCL018W 1095 nt9.9□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 UGP1YKL035W 1500 nt9.9□□□□□ -0.82
SSF2Q12153 CDD1YLR245C 429 nt9.88□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 YMR265CYMR265C 1386 nt9.88□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 RPD3YNL330C 1302 nt9.87□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 FSH2YMR222C 672 nt9.87□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 SWT21YNL187W 1074 nt9.87□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 HAP5YOR358W 729 nt9.87□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 snR31snR31 225 nt9.87□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 RPN14YGL004C 1254 nt9.86□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 ZAP1YJL056C 2643 nt9.86□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 SUV3YPL029W 2214 nt9.86□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 SFL1YOR140W 2301 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 NAM8YHR086W 1572 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 NAS6YGR232W 687 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 SNX3YOR357C 489 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 IPL1YPL209C 1104 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 MET1YKR069W 1782 nt9.85□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 SLG1YOR008C 1137 nt9.84□□□□□ -0.83
SSF2Q12153 YCR025CYCR025C 411 nt9.83□□□□□ -0.84
SSF2Q12153 YKR012CYKR012C 378 nt9.83□□□□□ -0.84
SSF2Q12153 ADH3YMR083W 1128 nt9.83□□□□□ -0.84
SSF2Q12153 YPL041CYPL041C 624 nt9.82□□□□□ -0.84
SSF2Q12153 MOB1YIL106W 945 nt9.81□□□□□ -0.84
SSF2Q12153 YKL053WYKL053W 375 nt9.81□□□□□ -0.84
SSF2Q12153 CRC1YOR100C 984 nt9.81□□□□□ -0.84
SSF2Q12153 ACO2YJL200C 2370 nt9.81□□□□□ -0.84
SSF2Q12153 PHB2YGR231C 933 nt9.8□□□□□ -0.84
SSF2Q12153 TIM44YIL022W 1296 nt9.8□□□□□ -0.84
SSF2Q12153 FLX1YIL134W 936 nt9.8□□□□□ -0.84
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