Protein–RNA interactions for Protein: Q12042

YPL162C, Vacuolar membrane protein YPL162C, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL162CQ12042 LPD1YFL018C 1500 nt7.03□□□□□ -1.28
YPL162CQ12042 YPS3YLR121C 1527 nt7.03□□□□□ -1.28
YPL162CQ12042 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.03□□□□□ -1.28
YPL162CQ12042 SMM1YNR015W 1155 nt7.03□□□□□ -1.28
YPL162CQ12042 RPD3YNL330C 1302 nt7.02□□□□□ -1.28
YPL162CQ12042 HBS1YKR084C 1836 nt7.02□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 YMR262WYMR262W 942 nt7.02□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 MSC1YML128C 1542 nt7.01□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 BNI5YNL166C 1347 nt7.01□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 FLR1YBR008C 1647 nt7□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 OSH7YHR001W 1314 nt7□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 RIB7YBR153W 735 nt6.99□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 DLD2YDL178W 1593 nt6.99□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 RPT5YOR117W 1305 nt6.99□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 TPN1YGL186C 1740 nt6.98□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 RSC4YKR008W 1878 nt6.98□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 INH1YDL181W 258 nt6.98□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 RAS2YNL098C 969 nt6.98□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 CSM1YCR086W 573 nt6.97□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 VRG4YGL225W 1014 nt6.97□□□□□ -1.29
YPL162CQ12042 FRA1YLL029W 2250 nt6.96□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 LSM5YER146W 282 nt6.96□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 DLD3YEL071W 1491 nt6.96□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 HXT12YIL170W 1374 nt6.95□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 FET5YFL041W 1869 nt6.95□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 FUB1YCR076C 753 nt6.94□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 YLR046CYLR046C 813 nt6.94□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 DUR3YHL016C 2208 nt6.93□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 OYE2YHR179W 1203 nt6.93□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 RIM2YBR192W 1134 nt6.93□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 DUS3YLR401C 2007 nt6.93□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 YJL118WYJL118W 660 nt6.92□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 RPC31YNL151C 756 nt6.92□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 AIM1YAL046C 357 nt6.91□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 ENT4YLL038C 744 nt6.91□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 ORT1YOR130C 879 nt6.91□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 TOM71YHR117W 1920 nt6.9□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 ASP3-1YLR155C 1089 nt6.9□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 ASP3-2YLR157C 1089 nt6.9□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 ASP3-3YLR158C 1089 nt6.9□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 ASP3-4YLR160C 1089 nt6.9□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 POP2YNR052C 1302 nt6.9□□□□□ -1.3
YPL162CQ12042 HEM13YDR044W 987 nt6.89□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 CAB5YDR196C 726 nt6.89□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 GPN2YOR262W 1044 nt6.89□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 MET30YIL046W 1923 nt6.88□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 LEU4YNL104C 1860 nt6.88□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 KRR1YCL059C 951 nt6.88□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 snR4snR4 186 nt6.88□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 ADE16YLR028C 1776 nt6.87□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 SOL2YCR073W-A 948 nt6.87□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 YJL055WYJL055W 738 nt6.87□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 VMA11YPL234C 495 nt6.87□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 DPL1YDR294C 1770 nt6.87□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 MCM5YLR274W 2328 nt6.86□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 TIP1YBR067C 633 nt6.86□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 NPP2YEL016C 1482 nt6.85□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 RIB2YOL066C 1776 nt6.85□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 EAF3YPR023C 1206 nt6.85□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 MAS1YLR163C 1389 nt6.84□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 YIL177CYIL177C 5277 nt6.84□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt6.84□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 YNL190WYNL190W 615 nt6.84□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 YNR029CYNR029C 1290 nt6.84□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 ADH1YOL086C 1047 nt6.84□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 ITR2YOL103W 1830 nt6.84□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 ALR1YOL130W 2580 nt6.84□□□□□ -1.31
YPL162CQ12042 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.83□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.83□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.83□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 TPS1YBR126C 1488 nt6.83□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 TRP2YER090W 1524 nt6.82□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 SNX3YOR357C 489 nt6.82□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 YJL195CYJL195C 702 nt6.81□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 SAM3YPL274W 1764 nt6.81□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 GAL3YDR009W 1563 nt6.8□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 HXT11YOL156W 1704 nt6.8□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 YDR467CYDR467C 327 nt6.79□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 NSG2YNL156C 900 nt6.79□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 PFS2YNL317W 1398 nt6.79□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 THI6YPL214C 1623 nt6.79□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt6.78□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt6.78□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 SFL1YOR140W 2301 nt6.78□□□□□ -1.32
YPL162CQ12042 TMA23YMR269W 636 nt6.77□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 LAS17YOR181W 1902 nt6.77□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 YRF1-1YDR545W 5391 nt6.77□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 YRF1-5YLR467W 5391 nt6.77□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 YRF1-8YOR396W 5391 nt6.77□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 HSV2YGR223C 1347 nt6.76□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 RRT8YOL048C 1029 nt6.76□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 DDI1YER143W 1287 nt6.75□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 FUN14YAL008W 597 nt6.75□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 YLR173WYLR173W 1827 nt6.75□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 TAT2YOL020W 1779 nt6.74□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 YEL008WYEL008W 381 nt6.74□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 IMO32YGR031W 1029 nt6.74□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 TAF13YML098W 504 nt6.74□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 IML3YBR107C 738 nt6.74□□□□□ -1.33
YPL162CQ12042 SRM1YGL097W 1449 nt6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.4 ms