Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 STP3YLR375W 1032 nt7.7□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 GID8YMR135C 1368 nt7.7□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 SGA1YIL099W 1650 nt7.7□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 ABZ2YMR289W 1125 nt7.69□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 FRE6YLL051C 2139 nt7.69□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 YNR064CYNR064C 873 nt7.68□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 TUB4YLR212C 1422 nt7.68□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 SAC7YDR389W 1965 nt7.68□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 OPI3YJR073C 621 nt7.67□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 PGC1YPL206C 966 nt7.67□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 DLD3YEL071W 1491 nt7.67□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 TIP1YBR067C 633 nt7.66□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 ENO2YHR174W 1314 nt7.66□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 YKL133CYKL133C 1392 nt7.65□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 KRE1YNL322C 942 nt7.65□□□□□ -1.18
NIP7Q08962 PAR32YDL173W 888 nt7.63□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 ELO1YJL196C 933 nt7.63□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 APS2YJR058C 444 nt7.63□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 HSL7YBR133C 2484 nt7.63□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 ITR2YOL103W 1830 nt7.63□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 MRS6YOR370C 1812 nt7.62□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 VMA11YPL234C 495 nt7.62□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 YBR232CYBR232C 360 nt7.62□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 UGP1YKL035W 1500 nt7.62□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 KEL3YPL263C 1956 nt7.61□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 NIF3YGL221C 867 nt7.61□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 AMF1YOR378W 1548 nt7.61□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 YHR219WYHR219W 1875 nt7.6□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 RPD3YNL330C 1302 nt7.6□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 LSR1LSR1 1175 nt7.6□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 RPN14YGL004C 1254 nt7.59□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 PCP1YGR101W 1041 nt7.59□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 SEN2YLR105C 1134 nt7.59□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 RIM8YGL045W 1629 nt7.59□□□□□ -1.19
NIP7Q08962 snR31snR31 225 nt7.58□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 NAP1YKR048C 1254 nt7.57□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 HAP5YOR358W 729 nt7.57□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 YMR265CYMR265C 1386 nt7.57□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 ZAP1YJL056C 2643 nt7.56□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 TPC1YGR096W 945 nt7.56□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 SPE2YOL052C 1191 nt7.56□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 SNX3YOR357C 489 nt7.56□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 TIM44YIL022W 1296 nt7.55□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 LEU2YCL018W 1095 nt7.55□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 YGL114WYGL114W 2178 nt7.54□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 IGD1YFR017C 588 nt7.53□□□□□ -1.2
NIP7Q08962 CWP2YKL096W-A 279 nt7.52□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 SWT21YNL187W 1074 nt7.52□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 SUV3YPL029W 2214 nt7.52□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 KRR1YCL059C 951 nt7.51□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 THP3YPR045C 1413 nt7.51□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 MET1YKR069W 1782 nt7.51□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 HEL2YDR266C 1920 nt7.5□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 SSL2YIL143C 2532 nt7.5□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 NAS2YIL007C 663 nt7.5□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 YJL064WYJL064W 396 nt7.5□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 FSH2YMR222C 672 nt7.5□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 ODC1YPL134C 933 nt7.5□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 NAM8YHR086W 1572 nt7.5□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 SFL1YOR140W 2301 nt7.49□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 CRC1YOR100C 984 nt7.48□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 PAU19YMR325W 375 nt7.47□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 YMR209CYMR209C 1374 nt7.46□□□□□ -1.21
NIP7Q08962 YKL053WYKL053W 375 nt7.46□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 YKR012CYKR012C 378 nt7.46□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 RPC31YNL151C 756 nt7.46□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 MDM35YKL053C-A 261 nt7.44□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 REX2YLR059C 810 nt7.44□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 SRP54YPR088C 1626 nt7.44□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 MOB1YIL106W 945 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 CDD1YLR245C 429 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 IPL1YPL209C 1104 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 MET2YNL277W 1461 nt7.43□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 DMA2YNL116W 1569 nt7.42□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 YCR025CYCR025C 411 nt7.42□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 ADH3YMR083W 1128 nt7.42□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 RIM2YBR192W 1134 nt7.42□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 FLX1YIL134W 936 nt7.41□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 PUP1YOR157C 786 nt7.41□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 ACO2YJL200C 2370 nt7.4□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 YRF1-2YER190W 5046 nt7.4□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 PHB2YGR231C 933 nt7.4□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 KGD2YDR148C 1392 nt7.4□□□□□ -1.22
NIP7Q08962 SFP1YLR403W 2052 nt7.39□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 SBP1YHL034C 885 nt7.39□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 YPT11YNL304W 1254 nt7.39□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 CYT1YOR065W 930 nt7.39□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 GID7YCL039W 2238 nt7.39□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 SAN1YDR143C 1833 nt7.38□□□□□ -1.23
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