Protein–RNA interactions for Protein: Q07457

BRE1, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE1Q07457 YMR262WYMR262W 942 nt10.42□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 ENT4YLL038C 744 nt10.41□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 COQ8YGL119W 1506 nt10.4□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 PAU5YFL020C 369 nt10.4□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 ESS1YJR017C 513 nt10.4□□□□□ -0.74
BRE1Q07457 RSC4YKR008W 1878 nt10.39□□□□□ -0.75
BRE1Q07457 SPS100YHR139C 981 nt10.39□□□□□ -0.75
BRE1Q07457 YLR046CYLR046C 813 nt10.39□□□□□ -0.75
BRE1Q07457 KES1YPL145C 1305 nt10.38□□□□□ -0.75
BRE1Q07457 YJR114WYJR114W 393 nt10.37□□□□□ -0.75
BRE1Q07457 PGC1YPL206C 966 nt10.36□□□□□ -0.75
BRE1Q07457 SAC7YDR389W 1965 nt10.35□□□□□ -0.75
BRE1Q07457 GID8YMR135C 1368 nt10.33□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 TVP23YDR084C 600 nt10.32□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 STP3YLR375W 1032 nt10.32□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 SGA1YIL099W 1650 nt10.31□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 OPI3YJR073C 621 nt10.31□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 GSF2YML048W 1212 nt10.31□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 SFP1YLR403W 2052 nt10.3□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 APS2YJR058C 444 nt10.3□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 ABZ2YMR289W 1125 nt10.29□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 TUB4YLR212C 1422 nt10.29□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 DLD3YEL071W 1491 nt10.29□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 NIF3YGL221C 867 nt10.28□□□□□ -0.76
BRE1Q07457 ITR2YOL103W 1830 nt10.27□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 MET2YNL277W 1461 nt10.26□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 YNR064CYNR064C 873 nt10.26□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 YBR232CYBR232C 360 nt10.26□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 HIS2YFR025C 1008 nt10.25□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 MRS6YOR370C 1812 nt10.25□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 YKL133CYKL133C 1392 nt10.25□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 YHR219WYHR219W 1875 nt10.24□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 UGP1YKL035W 1500 nt10.23□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 ELO1YJL196C 933 nt10.23□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 ENO2YHR174W 1314 nt10.22□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 HSL7YBR133C 2484 nt10.22□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 SEN2YLR105C 1134 nt10.21□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 LSR1LSR1 1175 nt10.21□□□□□ -0.77
BRE1Q07457 ZAP1YJL056C 2643 nt10.2□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 PAR32YDL173W 888 nt10.2□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 YDR306CYDR306C 1437 nt10.2□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 TIP1YBR067C 633 nt10.2□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 KRE1YNL322C 942 nt10.19□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 AMF1YOR378W 1548 nt10.17□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 KEL3YPL263C 1956 nt10.17□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 TPC1YGR096W 945 nt10.16□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 VMA11YPL234C 495 nt10.16□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 RIM8YGL045W 1629 nt10.15□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 GTB1YDR221W 2109 nt10.15□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 PCP1YGR101W 1041 nt10.15□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 SPE2YOL052C 1191 nt10.15□□□□□ -0.78
BRE1Q07457 RPD3YNL330C 1302 nt10.13□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 NAS2YIL007C 663 nt10.13□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 YJL064WYJL064W 396 nt10.12□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 YMR265CYMR265C 1386 nt10.12□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 SUV3YPL029W 2214 nt10.11□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 IGD1YFR017C 588 nt10.11□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 NAP1YKR048C 1254 nt10.11□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 SWT21YNL187W 1074 nt10.11□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 HAP5YOR358W 729 nt10.11□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 HEL2YDR266C 1920 nt10.11□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 SFL1YOR140W 2301 nt10.11□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 GNP1YDR508C 1992 nt10.1□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 TOK1YJL093C 2076 nt10.1□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 YGL114WYGL114W 2178 nt10.09□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 SNX3YOR357C 489 nt10.09□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 GAL2YLR081W 1725 nt10.09□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 PUS7YOR243C 2031 nt10.09□□□□□ -0.79
BRE1Q07457 CDD1YLR245C 429 nt10.08□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 LEU2YCL018W 1095 nt10.08□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 SSL2YIL143C 2532 nt10.08□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 MET1YKR069W 1782 nt10.08□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 THP3YPR045C 1413 nt10.07□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 RPN14YGL004C 1254 nt10.07□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 snR31snR31 225 nt10.07□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 TIM44YIL022W 1296 nt10.06□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 CRC1YOR100C 984 nt10.06□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 ODC1YPL134C 933 nt10.06□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 PAU19YMR325W 375 nt10.05□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 NAM8YHR086W 1572 nt10.05□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 YKL053WYKL053W 375 nt10.04□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 CWP2YKL096W-A 279 nt10.04□□□□□ -0.8
BRE1Q07457 FSH2YMR222C 672 nt10.02□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 PUP1YOR157C 786 nt10.02□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 YMR209CYMR209C 1374 nt10.01□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 YKR012CYKR012C 378 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 Q0010Q0010 387 nt10□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 ADH3YMR083W 1128 nt9.99□□□□□ -0.81
BRE1Q07457 RPC31YNL151C 756 nt9.99□□□□□ -0.81
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